TCGA泛癌全基因组分析(PCAWG)介绍
我们都知道在TCGA数据库当中,包括了33种所有实体肿瘤的测序的结果(如果不知道的话,可以看我们今天的第二条推送哦!)。我们在进行TCGA数据分析的时候,除了可以对单一的癌种进行分析之外。还可以对所有的33种肿瘤进行统一的分析解读,来寻找33种肿瘤当中所存在的共同的特征。这就是我们说到的泛癌分析了。
关于泛癌分析的计划,从2013年就开始了。那个时候就提到了要对TCGA的所有数据来来进行整合的分析。
在2018年的时候,TCGA的相关工作人员在cell旗下的等一系列的高分杂志上发表了27篇相关的相关泛癌分析的文献。当时的那个计划叫做泛癌图谱(Pan-Cancer Atlas)。
再往后系统的泛癌分析接下来就是到了今年的PCAWG了。
泛癌全基因组分析(Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes , PCAWG)是TCGA的相关工作人员,利用TCGA数据当中的WGS(全基因组测序)的数据。对所有肿瘤在DNA水平上的统一的分析。而这次的话,在nature旗下的杂志一次性的发表了17篇文章 (下一次的泛癌文章,会不会发到science旗下呢?)。
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