Southern杂交检测样本收集注意事项
1. 新鲜组织:
用解剖刀等迅速切成小碎块,约30-100 mg,放入2.0 mL离心管中,开盖液氮速冻15 min,-80℃保存,干冰运输。
每个southern blot泳道提供2-3管样品。
注:(1) 解剖刀处理组织的时间尽量控制在1 min以内。
(2) 液氮速冻时必须开盖,以防炸裂。
(3) 对于较难提取的植物组织,如苎麻、榨菜、枣子 、鱼、甘蔗、大署等,1-2 g样品用铝箔纸包好,液氮速冻15 min,-80℃保存,干冰运输。
2. 细胞样品:
悬浮细胞 1000-1500 rpm,5 min,常温离心收集细胞。贴壁细胞用胰蛋白酶消化后,吹打收集,PBS洗涤细胞,去除多余培养基和胰蛋白酶。开盖液氮速冻15 min, -80℃保存,干冰运输。
一般情况下,细胞培养的6孔板,每孔细胞数量约为0.5~2×106个。每个离心管中的细胞数量控制在5×106个左右!每个southern blot泳道提供2-3管样品。
3. DNA样品(双蒸水水溶解):
2-8℃短期保存,-20℃长期保存;加冰块低温运输。
质量检测
取1-2 μL的DNA进行琼脂糖凝胶电泳,无蛋白质和RNA等物质污染,无降解弥散,条带清晰。
纯度、浓度检测
OD260/280=1.8~2.0,OD260/280>2.0;浓度≥100 ng/μL 。
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