科研成果两年登上《Nature》,离开华大后,他如何用三年实现肠道菌群产业化

曾带领团队完成肠道菌群基因集构建,超越欧美登上《Nature》

人体细胞与生活在人体内部和表面的细菌的比例大约是1:1.3,说人类是细菌的寄居体也不夸张。

人体的生理健康状况除了受到自身基因调控、环境因素的影响外,必须不能忽视的另一大影响因素是与人体共生的细菌这一庞大群体。而这些细菌中的绝大多数生活在人的肠道中,它们被统称为肠道菌群。

人类自身的基因是先天决定的,改变人体自身的基因除了技术难关外,还可能会涉及伦理道德问题;但利用和改变肠道菌群,从而对人体健康产生有益影响,这越来越受到科研圈与产业界的重视。

大量研究表明,除了肠道炎症外,肠道微生物和肥胖、糖尿病、心血管疾病、癌症、类风湿性关节炎、抑郁症等疾病都存在关联。大量肠道微生物在临床方向的应用研究和产业转化方兴未艾。

如同参与1%的人类基因组计划,在2008年,华大基因参与欧盟发起的人体肠道宏基因组计划(MetaHIT)可以说是中国微生物组学研究的起点,同时也是谱元科技的起点(多名成员参与了此研究计划)。

以王俊、覃俊杰为代表的青年科学家在这项计划中发挥了极其重要的作用,为中国微生物组学的研发,开展了很多基础性和开拓性的工作。

当时欧洲也有团队在参与并开展相关工作。那会儿还是博士研究生的谱元科技创始人覃俊杰作为项目负责人,带领一群意气风发的年轻团队夜以继日,与欧洲团队赛跑,揭秘人体肠道菌群。

覃俊杰回忆到:“从微生态学而言,我当时是新入行的门外汉,但是依靠着全球领先的技术平台,有些‘肆无忌惮’地四处开拓。正是以二代测序为代表的组学技术与微生态学紧密结合后,诞生了微生物组学。”

这项计划中,他们发现了1000多个人体肠道常驻基因和超过330万个细菌的基因。不满足于把肠道菌群仅仅看做孤立的个体,覃俊杰带领团队紧接着从与人类疾病相关的角度去解读人类肠道菌群。

功夫不负有心人,他们发现了肠道菌群和二型糖尿病之间的紧密关系,这仅仅是覃俊杰和他的团队与微生态健康的不解之缘的一个开始。

8年后,覃俊杰从最初的一位微生态的门外汉,不仅成为了微生态领域的国内甚至全球科研系统的翘楚,更转型为一位能够敏锐感知行业动向、应对更加复杂多元挑战的创业者,他所创立的谱元科技成为了微生态领域的领军企业。

出走华大基因这颗大树,开拓微生物森林

离开华大基因时,在导师王俊和华大基因董事长汪建的支持下,覃俊杰已经建立了微生物组信息分析、活菌筛选与培养、动物模型、益生菌/益生元产品转化等功能单元。他已经创立了领先国外的平台。

谈到出走华大基因,覃俊杰说到:“直觉告诉我,新技术会促进微生态产业的极速发展。我想全身心地、专注地投入到这个产业中,如同用我的生命去完成一件艺术品。”

2014年7月谱元科技成立,覃俊杰从醉心于学术的科学家成功转型成长为一位搏击商海的创业者。得益于曾经扎实的科研训练和深厚的技术积累,谱元科技高度重视研发、视核心技术为企业的生命线。在研发上谱元设立了深圳市谱元基因研究院、深圳谱元医学检验实验室。通过与国内及海外知名科研机构合作,利用项目研发推动科研转化,实现了“产、学、研”联动。

谱元科技采用先进的微生物组技术,致力于科技服务、微生态健康、临床检测三大领域的技术开发及产品应用。主要有三条产品线:

一是技术服务,涵盖医学、健康、农业、环境等多个领域。例如在医学领域中,以疾病的精准诊断和精准治疗为目标,研究人体微生物组在其中所扮演的角色,从而开发微生态检测和微生态治疗的解决方案;在健康领域,从肠道菌群健康的角度来评价各类健康食品、养生方案的功效;

在农业领域可以开发微生物在农作物生长和畜牧养殖中的价值;在环境领域通过微生物进行环境监测,利用微生物进行环境污染治理和生态修复。

谱元提供的不止有测序,更有完整的微生态技术解决方案。依托于强大的科研技术团队,谱元可以提供从技术方案设计到分析报告、产品设计的全流程业务。

二是基于微生物组学的健康产品,开展个性化的肠道健康管理服务。根植业界领先的技术、依托广泛深入的上下游产业链的市场合作,谱元科技构建了生命健康大数据库,面向中国人提供肠道菌群、皮肤菌群、口腔菌群与生殖道菌群等多维度宏基因组检测及干预产品的个性化定制。

目前谱元科技已与中粮营养健康研究院、北上广深杭等地的多家三甲医院和健康管理公司进行不同层面的合作,完成了从研发到产业化的架构搭建,使研发成果能够更快速地推向商业化。

三是临床方向。能够为医疗及科研机构提供病原微生物快速检测和肠道菌群伴随检测服务,助力精准医学,为每个患者提供更先进、更准确的个性化治疗。

高标准的数据库,雄厚的人才资源支撑丰富产品线

在数据库建设上,除了聚焦数据的数量级,谱元科技更是做了横向延伸,如数据产出的标准、数据挖掘的算法、数据解读的知识库,引领推动该领域的产业化进程。

2017年,谱元和中国医科院肿瘤医院、美国国家癌症中心建立了合作,采用美国标准对谱元的数据产出流程进行了全面评估,结果显示谱元的数据产出流程在国际上都是领先的。证明了谱元科技在数据产出、数据挖掘、数据解读上的深厚积累和全球领先的技术。

在围绕肠道菌群的产业化过程中,谱元建立了独立的微生物组检验实验室和肠道菌群检测生产线。来应对大规模检测和数据分析需求。

在人才建设上,谱元拥有专业的团队支持科学设计。团队成员有的是和覃俊杰一样出身华大基因,也有的是亲自培养的毕业生。团队整体拥有10年的微生物组分析经验,首个肠道菌群基因集构建团队,论文引用率超4500次。并且,团队崇尚创新精神,不满足于已有的技术,从2016年开始对微生物组技术进行升级,建立了面向多组学、个体化、大数据的全新技术平台。

谱元科技创立四年以来,2014年成立实现自负盈亏,2015年研发出产品,2016年实现首轮融资,2017年完善软硬件建设如微生物检测平台通过ISO标准和美国MBQC项目测评。2018年对于谱元来讲,又将是一个新的元年,这一年谱元将迎来既有产品线的全面升级,同时重磅推出多款与公众健康息息相关的新产品。

微生态行业内生问题,带来挑战和无限机会

微生态领域在国外炙手可热,国内得益于资本、下游市场的追捧,也处于快速跟进的状态。但是,覃俊杰也直言行业中存在的浮躁问题。

他说:“我认为现状是,剧本有,舞台也搭好了,就看演员怎么演。要说缺什么,我认为和国外相比,国内是形似而神不似,既缺乏内在的东西。只在国内看,可能不是太大问题,因为有资本和市场托底。”

虽然国内市场行情看涨,但是覃俊杰认为整个行业中的内生问题,即給谱元提出了挑战,也带给了谱元巨大的机会。

他表示:“参考益生菌行业的发展,我认为微生态相关产业最终会走向国际化。如果我们现在不注意,将来可能会发现在微生态产业中,仪器、试剂、算法、菌株、药物等都只能用国外的,或者国外产品效果最好。”

如何在国际化的微生态市场中抢占鳌头,增加中国自身在该领域的核心竞争力。覃俊杰认为重点还是在创新。“我们要在创新上多下功夫,不只是技术创新,还包括商业模式的创新。”

他认为,现在市场需要一个有能力对产业进行整合的标杆企业。“微生态产业上下游企业之间合作还不是太紧密。从科普教育,市场宣传到检测跟踪,干预调理,这是一个很大的产业链,需要有能力的企业来整合这个生态圈。”

未来以技术为发动机,围绕肠道菌群打造数字化平台

谈到肠道菌群的未来发展,覃俊杰表示未来肠道菌群对于提升健康服务,还有很大的空间。未来肠道菌群管理应用情景化、生态化,围绕肠道菌群打造数字化平台。

覃俊杰畅想了四大应用场景:

1、应用于慢病管理:高危人群,甚至普通人可以提前进行肠道菌群个性化干预,将当今社会的慢性疾病都扼杀在摇篮中。

2、利用智能设备:服下药丸,直接在消化道内实时监测你的肠道菌群、及其代谢产物等重要健康指标。

3、智能家居环境:智能厨房,个性化饮食配餐,尤其是将益生菌和益生元等作为日常补充食物,进入我们的日常三餐;智能卫生间(将是口腔、皮肤、大小便等样品检测的主要场所)会在我们刷牙、洗脸、洗澡、方便时,自动完成采集和检测,提供健康数据;空调、饮水机等智能设备将时刻监控呼吸空气和饮用水是否健康安全。

4、肠道菌群保养:通过菌群移植、微生态胶囊等方法进行肠道菌群“初始化”。

“那时候,每个人每天关注的不只有天气预报,还有自己的肠道健康预报。”他这样谈到。这是根据自身基因、肠道菌群、日常生活状态、饮食和运动信息等等各个维度数据,综合为个体健康进行实时分析和预警。

基于肠道菌群,除了上述让人身体更健康更长寿、精神更愉悦、大脑更聪慧的探索,细菌代谢产物这一巨大的宝库,还有待于将来的开发。为此,谱元科技也将增加布点,拓展商业渠道,增加谱元品牌的影响力;开展国际合作,充分发挥并主导中国在该领域的优势与地位。

文|杨雪

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