Nhanes数据库介绍及使用(一)
1. NHanes数据库介绍NHanes是比较有名的公共数据库,虽然已经有前人发过不少文章。但主要肯挖掘,还是有好文章产出。(以一篇BMJ文章为例:Weight change across adulthood in relation to all cause andcause specific mortality: prospective cohort study,真正诠释了啥叫不起眼的数据发大文章,所以说重要的还是idea)美国国家健康与营养调查( NHANES, National Health and Nutrition Examination Survey)是一项基于人群的横断面调查,旨在收集有关美国家庭人口健康和营养的信息。项目每年调查一个全国代表性的样本,约5000人,这些人群位于全国各县。NHANES访谈部分包括人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题。体检部分包括生理测量、实验室检查等内容。当然介绍的再多都不如自己去网站逛一逛https://www.cdc.gov/nchs/nhanes/index.htm2. NHanes数据库使用教程(以SAS为例)下载数据:(1) 网页直接下载:
以2005-2006的人口学数据为例,点击画红框的区域即可下载,数据为xpt格式(2) 代码下载:filename xptIn url "https://wwwn.cdc.gov/nchs/nhanes/2015-2016/DEMO_I.xpt"; libname xptIn xport;导入数据:(1) 网页下载数据集导入:libname XP xport "C:\NHANES\DATA\DEMO_I.xpt"; /*改成相应的硬盘地址*/data demo_i; set xp.demo_i;run; /*复制到work数据集,也就是临时数据集*/data mydata.demo_i; set xpt.demo_i;run; /*复制到mydata数据集,也就是永久数据集*/(2) 下载数据集导入:(只需要复制的步骤)data demo_i; set xp.demo_i;run; /*复制到work数据集,也就是临时数据集*/data mydata.demo_i; set xpt.demo_i;run; /*复制到mydata数据集,也就是永久数据集*/XPT文件格式批量导入(提高效率必备):.xpt扩展也被称为通常由SAS应用创建的数据格式,或许这就是为什么双击xpt文件也能打开的原因(当然双击的效率相较于代码还是略低)批量导入的话肯定要用到宏程序(需要修改的地方只有三处,均已中文注释):/* The code below creates a transport file in the temp folder for use by the macro */ libname testlib xport 'D:\NHANES\trans.xpt'; /*修改为存放xpt数据集的硬盘位置*/ proc copy in=sashelp out=testlib; select retail; run;/* Note: Macro starts here *//* Macro using PROC COPY and the XPORT engine for reading transport files*/%macro drive(dir,ext,out); %let filrf=mydir; /* Assigns the fileref of mydir to the directory and opens the directory */ %let rc=%sysfunc(filename(filrf,&dir)); %let did=%sysfunc(dopen(&filrf)); /* Returns the number of members in the directory */ %let memcnt=%sysfunc(dnum(&did)); /* Loops through entire directory */ %do i = 1 %to &memcnt; /* Returns the extension from each file */ %let name=%qscan(%qsysfunc(dread(&did,&i)),-1,.); /* Checks to see if file contains an extension */ %if %qupcase(%qsysfunc(dread(&did,&i))) ne %qupcase(&ext) %then %do; /* Checks to see if the extension matches the parameter value */ /* If condition is true, submit PROC COPY statement */ %if (%superq(ext) ne and %qupcase(&name) = %qupcase(&ext)) or (%superq(ext) = and %superq(name) ne) %then %do; libname old xport "&dir.\%qsysfunc(dread(&did,&i))"; libname new "&out"; proc copy in=old out=new; run; %end; %end; %end; /* Close the directory */ %let rc=%sysfunc(dclose(&did)); /* END MACRO */ %mend drive; /* Macro call *//*First parameter is the source folder, the second parameter is extension being *//*searched for, and the third parameter is the target directory for the *//*converted files. */ %drive(D:\NHANES,xpt,D:\NHANES\) /*前后修改为存放xpt数据集的硬盘位置,后一个多一斜杠*/3. 下一期内容预告介绍数据集以及研究设计基础知识及权重的使用4. 参考内容郭晓娟, 田国祥, 等. NHANES项目介绍及数据提取流程.[J]. 中国循证心血管医学杂志, 2019, 6(11):654-657.https://wwwn.cdc.gov/nchs/data/tutorials/file_download_import_SAS.sashttps://support.sas.com/kb/33/918.htmlhttps://www.cdc.gov/nchs/nhanes/index.htmhttps://www.reviversoft.com/zh-cn/file-extensions/xpt免费的赞不要忘记点一波,在此谢过~