文献精读分享

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA、GEO, SEER数据挖掘。



文献1: Cancer cells exploit an orphan RNA to drive metastatic progression

  1. 肿瘤 Vs. 正常 (细胞系+组织+动物模型组织)small RNA-seq筛选 oncRNA 200+

  2. 高转移细胞系 Vs. 低转移细胞系筛选到最显著的T3p,  细胞系验证, TCGA验证

  3. 细胞+动物体内外功能验证

  4. 结合蛋白-T3p-miRNA-下游靶基因

  5. 外泌体smRNA-seq验证

  6. image.png
  7. T3p的预后诊断价值

  8. 启示: 外泌体分泌的non-coding RNA(除miRNA外)对肿瘤转移的影响。

文献2:Loss of XIST in Breast Cancer Activates MSN-c-Metand Reprograms Microglia via Exosomal miRNA to

Promote Brain Metastasis

  1. 筛选差异lncRNA并多数据集验证,找到XIST

    image.png
  2. 体内外功能试验验证XIST对脑转移的影响

    image.png
image.png
  1. Mammary-specific knockout of XIST促进脑转移

image.png
image.png
  1. XIST敲除对细胞功能的影响-EMT和细胞干性

image.png
  1. XIST低表达与转移相关的通路调节

image.png
image.png
  1. XIST低表达分泌外泌体miRNA诱导肿瘤微环境

image.png
image.png

文献3:Hypoxic exosomes facilitate bladder tumor growth and development through transferring long non-coding RNA-UCA1

  1. 缺氧外泌体介导的细胞功能影响

image.png
  1. 肿瘤细胞摄取外泌体

    image.png
  2. lncRNA在肿瘤细胞外泌体中的表达情况

image.png
  1. 体外验证外泌体lncRNA表达对细胞功能的影响

image.png
  1. 动物实验验证外泌体lncRNA对成瘤的影响

image.png
image.png
  1. lncRNA的预后诊断作用

image.png
  1. 启示外泌体分泌lncRNA也能参与肿瘤微环境塑造交流


本期内容就到这里,我是白介素2,下期再见,点击下方框框留言。

(0)

相关推荐