血浆miRNA检测能代替外泌体miRNA检测吗?不能!
小编前言:小编曾被一个问题问过多次,那就是测量外泌体的表达水平、成分可以作为一种液体活检的方式来做疾病的诊断或预后是吧?那为什么不直接检测血液中的miRNAs的表达呢?何必先提取外泌体再检测,外泌体提取那么麻烦。小编只能说:外泌体中的成分及其丰度与总体血液中的是不一样的啊,有些差异表达在外泌体中明显,但可能在总体血液中,由于背景复杂可能被掩盖了的呀。这些只能是小编的猜测,常识性判断,相信多数人也会相信。这次小编搬出来证据了,具体来看下文吧。
液体活组织检查在近年来迅速发展,用于诊断和预后应用。这一进步的一个重要方面是我们对微RNA(miRNA)生物学了解的增长。对不断释放到血液中的外泌体内包装的miRNA的检测,或可反映了体内的病理变化。
来自美国俄亥俄州托莱多大学医学院的研究人员使用来自两种肾脏疾病动物模型(第5/6部分肾切除术(PNx))和双肾单夹(2K1C)模型的血浆和血浆来源的外泌体样品进行miRNAs分析。基于RT-qPCR的分析结果显示,血浆中的总miRNAs表达水平高于血浆来源的外泌体。使用来自相同体积血浆的200μL血浆或外泌体,分析的665个总miRNAs中的629个在来自假手术的大鼠的血浆样品中是可检测的,而在外周血中只有403个可检测到,其截止值设定为35个循环。此外,血浆中的平均miRNA表达水平比外泌体高约16倍。研究人员还发现了在外泌体内选择性富集的miRNAs。与假手术动物相比,进行PNx或2K1C手术的大鼠中来自血浆来源的外泌体的可检测miRNA的数量增加。重要的是,他们发现在血浆中测量的单个miRNAs的变化与在两种动物模型中在血浆衍生的外泌体中测量的变化非常差,这表明在这些疾病条件下血浆和血浆衍生的外泌体中的miRNA被差异调节。有趣的是,PNx和2K1C手术诱导了miRNAs表达的相似变化,这意味着在这两种疾病模型中常见的途径被激活。使用DIANA-miRPath v3.0的途径分析表明,显著改变的外泌体miRNAs与细胞外基质(ECM)受体相互作用和粘蛋白型-O-聚糖合成途径分别与组织纤维化和肾损伤有关。
外泌体miRNAs所参与的通路分析
这些结果表明,由于miRNAs的差异变化,外泌体miRNAs的测量不能被血浆中miRNAs的测量所代替,反之亦然。研究人员还表明,与肾脏疾病动物模型相关的一组与肾损伤和器官纤维化相关的miRNA在血浆衍生的外泌体中失调。
总之,该研究表明,miRNA可以在外泌体和血浆样品中检测出差异性的变化,这意味着不同的机制用于调控miRNA对外泌体或其他载体的包装。该研究结果还提供了有关外泌体争议的信息,涉及外泌体或全血浆是否应用于循环miRNA测量。该研究结果表明,这两个测量表示在疾病发病过程中发生的不同生物过程的snapshots,可能不能被彼此替代。
参考文献:
Xie JX, Fan X, Drummond CA, Majumder R, Xie Y, Chen T, Liu L, Haller ST, Brewster PS, Dworkin LD, Cooper CJ, Tian J. (2017) MicroRNA profiling in kidney disease: Plasma versus plasma-derived exosomes. Gene [Epub ahead of print]. IF=2.319