宏基因组学[宏基因组学]
采用宏基因组技术及基因组测序等手段,来发现难培养或不可培养微生物中的天然产物以及处于“沉默”状态的天然产物。宏基因组不依赖于微生物的分离与培养,因而减少了由此带来的瓶颈问题。
随着新一代测序技术的迅猛发展,研究宏基因组的方法也已经发生了翻天覆地的变化:传统的方法是测定微生物基因组上的16S rRNA基因,这些基因的长度通常在1500个碱基左右,广泛分布于原核生物,既能提供足够的信息,而且具有相对缓慢的进化过程;其保守性与特异性并存,通过保守区和特异区来区别微生物的种属。基于这些特性,科学家们通过选择这些基因区域,方便地研究环境中物种的组成多样性,但是还不能全面分析环境中的基因功能。而现在,新一代高通量低成本测序技术的广泛应用,科学家们可以对环境中的全基因组进行测序,在获得海量的数据后,全面地分析微生物群落结构以及基因功能组成等。
短短几年来,宏基因组学的研究已经渗透到各个领域,从海洋到陆地,再到空气,从白蚁到小鼠,再到人体,从发酵工艺到生物能源,再到环境治理等。
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