重磅 | 小麦多组学网站上线小麦族Vmap1.0数据

昨天，中国科学院遗传与发育生物学研究所鲁非研究组和焦雨铃研究组合作完成的研究刚在Nature genetics上发表，文中对小麦属和粗山羊草属的25个小麦近缘亚种共414份材料进行全基因组测序，构建了小麦属全基因组遗传变异图谱（VMap 1.0）。我们也拿到了这批数据的vcf文件，经过注释之后放到小麦多组学网站上中国春JBrowse中(http://202.194.139.32/jbrowse-1.12.3-release/?data=Chinese_Spring)。具体的访问方式如下图所示。

对于感兴趣的基因大家可以在JBrowse中输入基因的ID，然后跳转到对应的基因组区间，选择Vmap1.0数据集即可展示该基因在该数据集中的变异情况。具体的每一个位点，大家可以左键点击即可。具体的操做如下：

具体的引物信息和样本信息如下图所示的方式进行查询和下载，具体的操作可参考上方视频。