2020年度回顾 | 技术贴合辑

今天微生太将和大家回顾一下往期技术贴的微文，包括了以下5个类别：

【1 微生太宏基因组报告解读】

【2 R语言】

【3 宏基因组&宏转录专题】

【4 扩增子专题】

【5 其他】

1 微生太宏基因报告解读

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读（开篇）

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第一篇：测序数据过滤

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第二篇：物种组成分析

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第三篇：物种分组统计分析

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第四篇：PCoA、NMDS、RDA/CCA、相关分析

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第五篇：EggNOG、CAZy、CARD等7大数据库助力宏基因组功能分析

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第六篇：功能分析-基于KEGG数据库

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第七篇：功能分析-基于GO数据库

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第八篇：功能分析-基于MetaCyc数据库

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第九篇：功能分析-基于EggNOG数据库

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第十篇：功能分析-基于CAZy数据库

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第十一篇：功能分析-基于ENZYME数据库

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第十二篇：功能分析-基于抗性基因CARD数据库

2 R语言

技术贴 | R语言：ROC分析多样性指数

技术贴 | R语言：ggplot画柱形图、排序、着色

技术贴 | R语言：手把手教你搞定ggplot柱形图（一）

技术贴 | R语言：手把手教你搞定ggplot柱形图（二）

技术贴 | R语言：ggplot画散点图

技术贴 | R语言：组学关联分析和pheatmap可视化

技术贴 | R语言：合并散点图、箱图、密度图

技术贴 | R语言：常见的ggplot取色方法

技术贴 | R语言：ggplot堆叠图、冲积图、分组分面、面积图

技术贴 | R语言：绘制基因组基因箭头图

技术贴 | R语言：VennDiagram绘制venn图

技术贴 | R语言：envfit环境因子和菌群回归分析

技术贴 | R语言：手把手教你画pheatmap热图

技术贴 | 手把手教你如何画Circos图

技术贴 | R语言：手把手教你画upset集合图

技术贴 | R语言：ggplot绘图的Y轴截断和拼接

技术贴 | R语言——肠型分析：介绍、方法

3 宏基因组&宏转录组专题

技术贴 | 宏基因组分箱Binning（一）介绍和报告展示

技术贴 | 宏基因组Binning（二）质控、分箱、质检、可视化

技术贴 | 宏基因组Binning（三）丰度计算、差异分析

技术贴 | 宏基因组分箱 (Binning)第四课——COG EC RNA注释统计

技术贴 | 宏基因组分箱Binning（五）KEGG GO注释统计

技术贴 | 宏基因组Binning（六）CAZyme注释统计

技术贴 | 宏基因组Binning（七）进化分析，基因组圈图

技术贴 | 宏基因组 + 宏转录组分析工具：HUMAnN

4 扩增子专题

无需转发，学术课程免费领取 | R语言进行菌群α多样性分析(附课程二维码)

无需转发，学术课程免费领取 | R语言进行菌群β多样性分析

无需转发，学术课程免费领取 | 免费 R语言进行微生物、环境因子相关性分析

无需转发，学术课程免费领取 | 论文图片的编辑和排版

无需转发，学术课程免费领取 | 微生太16S分析结果文件夹及结题报告的解读（上）

无需转发，学术课程免费领取 | 微生太16S分析结果文件夹及结题报告的解读

无需转发，学术课程免费领取 | QIIME2+Galaxy PICRUSt进行16S功能预测

无需转发，学术课程免费领取 | R语言Venn图分析组间特有和共有的物种

无需转发，学术课程免费领取 | 使用LEFSE寻找在组间有差异的特征微生物

无需转发，扩增子分析系列视频课程免费领取（含课程PPT以及示例代码）

5 其他

技术贴 | python: 字典、列表、表格相互转换

技术贴 | Python：fasta文件处理和GC含量统计

资源分享 | 微生物组分析必备书籍《Microbiome Analysis》

资源分享 | 实验室常用细菌及其作用选择介绍免费领取

最新微生物领域重要杂志2019年影响因子全面盘点

无需转发，免费领取 | 《环境微生物学培养基手册》工具书，（英文PDF）

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