组织特异性 Cre 真的那么特异吗?
师妹:师兄,应该是肝脏特异表达的 Cre,怎么好像在脑里也有表达?
师兄:唉,理想是丰满的,而现实往往是骨感的。其实,Cre 的非特异性表达是普遍存在的啊!大部分 Cre 品系在其它组织中也有 Cre 活性。
由于 Cre 的非特异性表达导致基因敲除的脱靶,有可能在你不自知的时候直接影响到你的实验数据。
比如,受神经元特异性 Emx1(empty spiracles homolog 1)启动子驱动的 Cre 小鼠,除了在新皮质和海马中高表达 Cre 以外,在肾脏和胸腺中也会表达 Cre。
图1. Emx1-Cre在大脑(A)、胸腺(B)、肾脏(C)的表达。(图片来自 jaxlab)
师兄:如果 Cre 的脱靶发生在生殖细胞里,那就有可能直接得到全身性敲除小鼠了。还是以 Emx1-Cre 为例,研究发现在一小部分生殖细胞中也有 Cre 表达,并且雄性与雌性都可能出现这样的脱靶。
师妹:那我怎么知道有没有发生生殖系脱靶呢?
师兄:我们可以通过 PCR 方法发现是否发生了全身敲除。只需要在 flox 区域的上下游分别设计一条上游引物和一条下游引物(下图橙色箭头)。
如果发生了全身敲除,那么在做基因型鉴定 PCR 时,会出现一条最短的条带。将带有这条短带的小鼠移除即可。
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