Nucleic Acids Research | 人类中枢神经系统冷冻保存组织中特定细胞类型的转录谱（一区:IF=11.147）

编译：不二，编辑：十九、江舜尧。

原创微文，欢迎转发转载。

美国哈佛大学干细胞和再生生物学研究所及哈佛医学院布拉瓦尼克研究所Paola Arlotta和Constance L. Cepko等人于2019年11月15日在生物方法学顶级期刊Nucleic Acids Research发表题目为《FIN-Seq: transcriptional profiling of specific cell types from frozen archived tissue of the human central nervous system》的文章，该研究为冷冻人类大脑组织中特定神经元细胞类型的病理学分子机制研究提供了重要参考价值。

文章摘要 

目前，脑库中有成千上万个来自人类中枢神经系统（CNS）冷冻保存的组织样本。随着RNA测序技术的发展，学术界开始阐明人类中枢神经系统内的细胞多样性，更深入的转录组学分析将极大地促进对这种多样性的了解。单细胞和单核RNA测序分析提供了一种解析这种异质性的方法。另一种方法是对特定细胞类型进行分离，再进行转录组测序，可应用于许多已长期冷冻保存的人体组织样本。本研究中，技术人员开发了一种可以实现这些目标的方法-冷冻免疫标记细胞核测序（FIN-Seq）。FIN-Seq使用免疫组织化学的方法，从冷冻的人体组织中分离特定细胞类型的细胞核，然后进行RNA测序。研究者将这种方法应用于人类大脑皮层和视网膜的冷冻样本，能够鉴定特定细胞类型中的转录本，包括低丰度表达的转录本。

文中重要图片说明

图1 | 冷冻小鼠新皮层中两种神经元亚型的分离和转录组测序。

图2 | 冷冻人类大脑皮层中神经元亚型的分离和转录组测序。

图3 | 冷冻人类视网膜中视锥感光细胞核的分离和转录组测序。

---