什么，你还不知道各种ngs组学价格吗

空间转录组服务（16个样本质检、优化、建库）只需要10W人民币哦，高通量单细胞转录组实验服务  （制备、质检、测序和分析，8样本）也只是需要20W人民币哦，你要是问我是怎么知道的，嘻嘻，有绝招：

其实就是中国科学院上海营养与健康研究所拟采购项目公示啦，基本上涵盖了绝大部分的主流ngs数据服务哦：

  • （营养：倒置荧光显微镜）2019.04.17
  • （营养：慢性干预实验餐）2019.03.25
  • （健康：全基因组测序）2019.03.11
  • （计算：荧光定量PCR检测系统）2019.02.19
  • 健康：食蟹猴毒性试验）2019.01.28
  • （健康：Hiseq X10 PE150测序）2019.01.23
  • （健康：短肽净化冻干）
  • （计算：全外显子测序）
  • （健康：10x单细胞纯测序）2019.05.28
  • （健康：全基因组测序）2019.05.27
  • （健康：单细胞测序）
  • （营养：甲基化芯片检测）2019.12.16
  • （计算：RNA测序）2019.05.16
  • （计算：犬DNA测序）2019.05.16
  • （代谢组学检测） 2020.10.30
  • （建库测序） 2020.10.27

可以进去细看，挺有意思的，就当做是扩充自己的知识面吧，每次采购招标都是 3个公司， 你会发现居然有那么多公司。(文末阅读原文即可查看，或者复制粘贴下面的URL去你的浏览器打开即可)

  • http://www.sinh.cas.cn/xwgg/ygcg/index_1.html
  • http://www.sinh.cas.cn/xwgg/ygcg/index_8.html

那么多测序数据，怎么分析呢

可以看看我们《生信技能树》的B站免费NGS数据处理视频课程:

目前，已经组建了微信交流群的有下面这些：

有生物信息学基础后学习更佳哦

再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理：

把R的知识点路线图搞定，如下：

  • 了解常量和变量概念
  • 加减乘除等运算（计算器）
  • 多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）
  • 多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）
  • 文件读取和写出
  • 简单统计可视化
  • 无限量函数学习

Linux的6个阶段也跨越过去 ，一般来说，每个阶段都需要至少一天以上的学习：

  • 第1阶段：把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅，主要目的就是去可视化，熟悉黑白命令行界面，可以仅仅以键盘交互模式完成常规文件夹及文件管理工作。
  • 第2阶段：做到文本文件的表格化处理，类似于以键盘交互模式完成Excel表格的排序、计数、筛选、去冗余，查找，切割，替换，合并，补齐，熟练掌握awk,sed,grep这文本处理的三驾马车。
  • 第3阶段：元字符，通配符及shell中的各种扩展，从此linux操作不再神秘！
  • 第4阶段：高级目录管理：软硬链接，绝对路径和相对路径，环境变量。
  • 第5阶段：任务提交及批处理，脚本编写解放你的双手。
  • 第6阶段：软件安装及conda管理，让linux系统实用性放飞自我。
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