第五届肾病中药发展研究大会蓝辉耀:人类肾脏病基因测序实现可视化
第五届肾病中药发展研究大会蓝辉耀:人类肾脏病基因测序实现可视化
2020年10月24日,在第五届肾病中药发展研究大会暨2020年京津冀中西医结合肾脏病学术年会上,蓝辉耀教授做了《单细胞测序在肾脏病研究中的应用》的主题报告。
单细胞RNA测序:测定每个细胞的基因表达谱,由此实现通过一次建库,测得数以万计的单细胞的基因信息表达。
此外,蓝辉耀教授表示,可以应用psuedotime研究单细胞特异基因表达对细胞分化与功能的调控。
UMAP(Uniform Manifold Approximation and Projection)非线性降维技术,应用可视化探索细胞群体分析,异质性与表型变化。UMAP为目前最常用的单细胞测序降维及可视化方法,用于检测细胞数量、分群、分布与表型变化的二维成像。UMAP细胞地图中,每个点代表一个细胞,颜色则对应细胞的类型/组别。
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