白介素2的科研神器大礼包汇总
欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA、GEO数据挖掘。
前言
此前笔者在小张聊科研、生信人、百味科研芝士、丁香园的科研论文时间等公众号分享过一些内容,主要包括以下几个方面:
生信在线分析工具:适合生物信息背景的科研人员,能快速上手做一些简单的数据挖掘。
生信文献解读 : 解读生信文献
科研杂谈: 科研总是乏味,临床总是疲累,聊一些有趣的事。
R语言生信分析: 记录一些R语言的生信分析方法,代码等。
为方便读者阅读,这里笔者将这些内容做了一个统一整理,命名为 白介素2的读书笔记
, 希望对大家有帮助。
在线分析神器
肿瘤免疫浸润分析工具汇总-数据挖掘新高度(肿瘤免疫浸润分析工具杂谈)
cibersort-发表在Nature Methods上的肿瘤免疫分析工具(免疫浸润cibersoft工具操作)
g:profiler:富集分析神器(好用的在线富集分析工具)
IRIS-EDA-在线分析RNA-seq神器(公共数据在线挖掘)
Networkanalyst-碉堡的GEO和RNA-seq数据在线分析神器,生信so easy!(公共数据在线挖掘)
BioJupies分析平台-又一个碉堡的RNA-seq数据分析神器,分析不求人(公共数据在线挖掘)
Pathview-只有这样的女神级KEGG通路图才配得上我的Paper和标书(通路可视化在线工具)
TRGAted-如何花5分钟给你的Paper加几张Figure?(TCGA蛋白数据挖掘在线工具)
同样是画热图,为啥不用R语言人家也能画得好看(在线画热图工具)
idep-不会R语言的前提下,一网打尽芯片,测序数据分析(公共数据在线挖掘工具)
scRNA-Tools-单细胞测序数据分析的航母-工具包大集合(单细胞测序数据分析工具汇总网站)
OBRC-跟这个数据库比,其他都弱爆了(生信工具数据库)
Treehouse:一个10000+肿瘤sample的数据库(公共肿瘤数据库)
如何优雅的用十分钟对Pubmed文本挖掘掌握研究现状?(R语言挖掘pubmed)
确认过眼神,是值得挖掘的单细胞测序数据库!(单细胞公共数据库)
肿瘤miRNA,这个数据库好用到爆!(肿瘤专用miRNA数据库)
我发现了一个挖掘肿瘤甲基化的神器库!(肿瘤甲基化数据挖掘工具)
确认过眼神,是比DAVID好用N倍的神器(功能富集分析工具)
把免疫相关基因「挑出来」?这个数据库帮你完成(免疫相关数据库)
CNS 的标配,单细胞测序数据挖掘神器推荐!(单细胞测序公共数据库)
一个逆天的small RNA-seq数据挖掘神器 (small RNA-seq在线挖掘神器)
在线平台如何做单细胞测序分析全套?有它so easy! (单细胞测序在线分析平台)
确认过眼神,TCGA甲基化分析工具再也没有更NB的了!(TCGA甲基化数据在线挖掘)
免疫组学10KIP-这个数据库好用到爆 (免疫组学数据库)
生信文献解读
基因表达与甲基化表达谱纯生信分析4分文章,你也可以 (甲基化与基因表达数据联合分析)
数据挖掘是怎样动脑的?以一篇文献为例(TCGA数据挖掘)
生信数据挖掘的9分SCI也是灌水?(多数据集联合分析)
CeRNA才是人生赢家,一篇著名的赤果果的文(tao)献(lu)(ceRNA网络分析)
对方向扔了一个赤果果的生信分析SCI思路(分类模型)
文献解读|8分的肿瘤大数据挖掘是怎样炼成的?(SEER联合TCGA数据库文章)
零代码数据挖掘还能不能发文章? (零代码数据挖掘文献解读)
零代码也能发3分的SCI?请收下这个套路 (零代码数据挖掘文献解读)
科研杂谈
endnote如何显示代表论文的作者全名(一个令人为难的要求)