基于pubmed文献分析网站推荐

对于文献检索而言。一些辅助的工具,可以帮助我们更好的了解检索到的主要内容。之前我们介绍过一介绍过几个可以用来进行分析的工具。比如:connectedpapersLitSensePubTator。以上的这些工具各有各的用途。今天就来在给大家介绍一个基于pubmed来进行分析的工具吧。

1. Pubreminer

Pubreminer是一个基于pubmed检索结果来统计分析的工具。我们只需要输入pubmed的检索式。同时也可以进行个性化选择,比如检索年限的限制。

例如,我们这里在标题和摘要当中检索TCGA,同时想要查看一下2018年以后的文献都有哪些。

通过检索之后,就可以返回检索到这些文章的统计信息。这个工具主要能对发表年限发表杂志关键词主题词发表类型进行统计。

利用这个工具其实也是可以进行投稿杂志筛选的。通过这样检索。我们发现利用TCGA发表的文献都有哪些。

2. Search Workbench

Search Workbench[https://searchworkbench.info/]是一个检查、编辑和可视化PubMed搜索结果的工具。在这个工具当中,

我们可以通过输入关键词TCGA,首先可以看到的是检索到的相关结果每年的发表占比。

如果我们在输入多个检索结果,比如再输入miRNA。这样就可以比较miRNA的检索检索结果和TCGA的检索结果了。比较结果一方面可以在发表占比当中看到。同时也会有一个Venn图来进行展示的。

在venn图当中,可以看到,TCGA发表的文章当中,涉及到miRNA的其实只占了一小部分。

写在最后

以上就是我们对pubmed在线挖掘的工具。有兴趣的同学可以用一下哈。这类的工具,对于我们进行简单的文献数据挖掘还是很有帮助的。有需要的童鞋可以试一下的哈。

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