艾沐蒽联合发表 | 通过TCR测序研究造血干细胞移植后的免疫重建与GVT效应
近日，艾沐蒽携手军事医学科学院、解放军第307医院、浙江大学纳米研究院联合发表题为“Quantitative Analysis of Thymus-Independent Donor-Derived T Cell Expansion in Transplant Patients ”的论文并担任共同通讯作者。本研究通过ImmuHub®技术平台进行深度TCR测序，研究异基因造血干细胞移植后的免疫重建以及移植物抗肿瘤效应（GVT）机理。
异基因造血干细胞移植(Allo-HSCT)是治疗血液系统恶性肿瘤(包括急性白血病和骨髓增生异常综合征)的最佳方法。
骨髓清除异位造血干细胞移植后，T细胞腔室有两种再生方式。一种是非依赖于胸腺的，另一种是依赖于胸腺的。胸腺非依赖性T细胞扩增至少在第一年生活中占主导地位，而与胸腺依赖型的T细胞再生直到胸腺功能恢复后才开始。移植后，移植物中成熟的T细胞会遇到和应对同种抗原，如不相容的HLA和次要组织相容性抗原，肿瘤相关的和肿瘤特异性抗原，会导致移植物抗宿主病（GVHD）和移植物抗肿瘤（GvT）效果。因此，胸腺非依赖型T细胞扩增反应了供者和受者抗原环境的差异，可能决定了GVHD的发生和复发，从而导致不良的临床结果。然而，胸腺非依赖型T细胞扩增的机理并不十分清楚。
这篇文章对供受者三个时间点样本进行TCR测序，以动态观察胸腺非依赖型T细胞扩增。研究中发现：
1.异基因造血干细胞移植后由于T细胞增殖表现为非特异性的，所以第一个月内T细胞增殖以内稳态驱动机制为主；
Figure 1. Comparison of conventional indices.
2. 移植后第二个月以抗原驱动为主，产生的效应主要为GvT效应，而不是GvHD；
Figure 2. Reliability of the ranking and the difference between conventional indices and the TCRI.
3.在传统的多样性和克隆性指数以外，我们引入了一个全新的指数TCRI（T细胞反应指数）， TCRI200bc≥1.0可提示患者存在有效的GvT效应，预示一年内无复发的可能性。
Figure 4. Comparison of the TCRI.
4.在1年内未复发的患者间，与GvT相关的TCR克隆共享一些相同的V和J片段。
Figure 5. Comparison of the usage frequency of each TRBV, TRBJ, and TRBD segment in the 1lg-clonotypes between the relapse group and the nonrelapse group.
遗憾的是，本论文通讯作者陈虎教授于今年7月24日因病逝世，享年57岁。
陈虎教授（1962-2019），全军造血干细胞移植中心主任、全军造血干细胞研究所所长、教授、博士生导师，血液病专业委员会副主任，曾牵头的“成体干细胞救治放射损伤新技术的建立与应用”获得国家科技进步一等奖，“间充质干细胞在急性放射病干细胞移植中诱导免疫耐受的研究”获得军队科技进步一等奖，2016年获得“何梁何利基金科学与技术进步奖”。曾荣立一等功1次、二等功1次、三等功1次。
参考文献：
Gao, X. et al. Quantitative Analysis of Thymus-Independent Donor-Derived T Cell Expansion in Transplant Patients. Biology of Blood and Marrow Transplantation (2019).
什么是ImmuHub®?
ImmuHub®是由艾沐蒽开发的一套灵活度极高的TCR和BCR二代测序平台。可根据不同样本类型和课题的需求为客户提供个性化的文库构建和测序模式，并配合世界领先的生物信息学算法提供可视化数据分析。
ImmuHub®适用的基因座
使用我们高度优化的文库构建方法，配合Illumina®测序平台，可以实现对以下TCR和BCR基因位点测序：
ImmuHub®适用的样本类型
可接受带有淋巴细胞样本的RNA或DNA，如：