GEO数据挖掘+实验验证,这样的生信发了4分+SCI

参考文章:Bioinformatic analysis identifying FGF1 gene as a new prognostic indicator in clear cell Renal Cell Carcinoma

分析思路:

1、通过GEO数据的差异分析,筛选出一定数量的差异基因

2、一共得到192个差异基因,并且进行GO富集分析和KEGG富集分析

3、将差异基因进行蛋白互作网络分析,并且筛选核心基因,作者选出了FGF1作为后续深入研究的基因

4、通过一系列的在线数据库验证FGF1的表达情况和预后情况

5、补充免疫组化和PCR实验验证FGF1的表达

6、在线数据库分析FGF1基因的理化特性以及其相关生物学功能、信号通路

总结:

作者通过GEO数据筛选出一定数量的差异基因,然后通过功能分析筛选一个值得深入研究的核心基因,先通过在线数据库分析验证这个基因的表达情况和预后情况,再补充免疫组化和PCR实验尽心验证。该分析思路简单清晰,比较容易实现,所花费的经费相对比较少。如果想将文章再上一个层次就需要进行一系列的功能实验,并且探索FGF1的作用机制,这也将花费更多的科研经费,并不是所有的研究者都有这么多经费,很有可能就是科研经费决定着这篇文章的深度

(0)

相关推荐

  • 生信加实验文章解读

    目前对于很多高分文章其实好多都是组学+实验的方式来做的.只不过各自比重不一样.好一些的可能只是那组学数据当作一个引子,中等的可能就是大部分是数据分析后面的实验只是来简单的拔高一下文章的分数.比如,我们 ...

  • 一篇最基本生信分析文献解读

    利用一周多的时间,我们把最最基本的生信套路来讲解了一遍.正好前几天一个小伙伴拿了一篇相关文献在咨询问题.这里就拿这篇文献来总结一下我们目前写的这些东西. 这次我们来讲解的这边文献是2019-10-12 ...

  • GEO数据挖掘+实验验证,实在太好发文章了

    文章题目: Identification of key genes, pathways and potential therapeutic agents for liver fibrosis usin ...

  • 单基因生信发准7分SCI,又又被致谢

    前段时间无意间发现有文章致谢我们公众号,然后拿出来炫耀了一下 被致谢!2021年7分+单基因泛癌纯生信,投稿到接受30天! 这不没过一个月又发现被致谢了,而且依然是个准7分的SCI,目前我们被4分以上 ...

  • 单基因生信发准7分SCI

    发表杂志:frontiers in Immunology 影响因子:5.085,即时影响因子:7.29 对于单基因的分析,挑选基因最为关键.小编认为容易发表的基因要符合以下几点(符合条件越多越好): ...

  • TCGA 数据挖掘+实验验证(老牌期刊非OA 准8分)

    研究背景: 前胶原赖氨酰羟化酶1(PLOD1)在恶性肿瘤中高表达,例如食道鳞状细胞癌,胃癌和大肠癌.生物信息学分析显示PLOD1与GBM的进展有关,尤其是最恶性的间充质亚型(MES).此外,在TCGA ...

  • 这本对纯生信友好的3分+SCI竟然在预警期刊名单上

    Cancer Biomarkers,是一本对纯生信友好的期刊,影响因子:3.436,中科院最新分区:4区,属于非OA期刊,不需要交版面费,审稿周期较长,一般都是需要4-6个月不等,赶时间的朋友需要谨慎 ...

  • 零代码纯生信 发7.7分2区杂志

    大家好,今天要和大家分享的是2020年12月份发表的一篇文章:"Genomicinvestigation of co-targeting tumor immune microenvironm ...

  • 单基因纯生信轻松发6分SCI

    大家好,今天要和大家分享的是2021年2月发表的一篇文章:"CTHRC1 Is a Prognostic Biomarker andCorrelated With Immune Infilt ...

  • 这本国人友好、接受纯生信文章的3分 SCI期刊值得收藏!

    网址: https://www.journals.elsevier.com/pathology-research-and-practice 1.期刊基本信息 Pathology - Research ...

  • 生信数据挖掘+实验验证(4分SCI思路)

    文章题目: Inhibition of mitochondrial carrier homolog 2 (MTCH2) suppresses tumor invasion and enhances s ...