Gaussian进行过渡态搜索

研究过渡态的结构在化学中是非常重要的内容，无论是确定反应的方向、势垒高度、反应路径等，都需要计算过渡态能量。在Gaussian软件中，过渡态能够非常方便的进行结构优化与振动分析。

下面我们以氢氧根对氟甲烷的亲核取代为例，练习如何使用QST2方法进行过渡态搜索。

QST2需要绘制基元反应的反应物与产物的结构，并使用链接编辑器（在Gaussian面板上像是一个锁链）将反应前后的原子一一对应。可以使用Autofixing进行自动对应，但是有时候自动对应会出错，这时就需要手动对原子进行序号的对应。

接着设置计算任务，选择Opt+freq，方法使用DFT，B3LYP，这里使用的基组是6-31G(p)。原谅我为了节省时间采用了小基组）

计算结果中Results→Vibrations打开振动分析器，出现的正确结果应该是有一个虚频（即负的振动频率，意味着势能面的鞍点，即过渡态结构），点击Animation，可以看到势能面上过渡态两侧振动的结构，可以用于初步判定是否是合理的过渡态结构。

振动模拟的结果如下：