Prediction of anti-tuberculosis treatment duration based on a 22-gene transcriptomic model. European Respiratory Journal, 2021; 2003492 DOI: 10.1183/13993003.03492-2020为了识别这种个体生物标记，DZIF内的科学家建立了五个不同的肺结核患者队列，包括非耐药性和耐药性肺结核。临床和微生物学数据，以及用于RNA转录组分析的全血在整个治疗过程中按预定的时间点收集。治疗结果按TBNET标准确定（6个月培养状态/1年随访）。在一个涉及机器学习算法的多步骤过程中开发了一个全血RNA治疗结束模型，以确定假设的个人治疗结束时间点。德国鉴定队列（DS-和MDR-GIC）招募了50名药物敏感（DS）肺结核患者和30名MDR肺结核患者，德国验证队列（DS-和MDR-GVC）招募了28名DS肺结核患者和32名MDR肺结核患者，罗马尼亚验证队列（MDR-RVC）招募了52名MDR肺结核患者。从DS-和MDR-GIC数据中推导出一个22个基因RNA模型，该模型定义了与治愈相关的治疗结束时间点。该模型优于其他已发表的标志物，能够准确预测DS-GVC患者的临床结果（AUC=0.94[95%CI:0.9-0. 98]），并提示MDR-GIC（平均减少218.0天，34.2%）、MDR-GVC（平均减少211.0天，32.9%）和MDR-RVC（平均减少161.0天，23.4）中的肺结核患者可能通过更短的治疗时间实现治愈。研究人员从成千上万的基因中，鉴定出22个其活性与疾病进程相关的基因，这22个基因的RNA产生可以表示患者是否已经治愈。到目前为止，没有其他已发表的转录组标记物显示出可比的特性。Borstel研究中心临床主任，研究负责人Christoph Lange表示：“治疗时间的个性化是结核病精准医学道路上的重要里程碑。” 该研究的重要价值在于，生物标志物指导下的治疗管理可以大幅缩短许多MDR-TB患者的治疗时间。下一步，研究人员计划在DZIF进行前瞻性研究，希望这样，耐多药结核病患者平均可以节省大约三分之一的治疗，这对患者来说，是极其有益的。据世界卫生组织（WHO）2019年公布的数据显示，结核病是全球十大死因之一，也是单一传染病致死人数最多的疾病（自2007年以来排名高于艾滋病）。全球约有1000万人患病，死亡人数高达120万。
2019年结核病发病率
2019年结核病＞10万的国家和地区tuberculosis report 2020. Geneva: World Health Organization; 2020. Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.事实上，自二战后，各国坚持严格实施现代结核病控制策略，肺结核发病有所下降。然而，20世纪90年代末开始，由于对TB疫情控制的松懈、移民和难民增加、HIV感染与AIDs流行以及多耐药结核病例增加，全球TB疫情却有所回升。2017年柳叶刀子刊发表的一项研究数据中显示，预测到2040年，俄罗斯近三分之一的结核病病例（32.5％）将是多药耐药性；在印度12.4％为多药耐药性；菲律宾为8.9％；南非为5.7％。这四个国家中将有十分之一的多药耐药结核病例具有广泛耐药性。该研究预测，耐药菌株将导致耐药结核病例的减少-从2000年的约30％的多药耐药结核病例减少到2040年的20-25％，以及80％的广泛耐药病例抗药性疾病在2000年增加到2040年的50％。
2000-2040年俄罗斯、印度、菲律宾和南非多药耐药性肺结核增长情况Estimating the future burden of multidrug-resistant and extensively drug-resistant tuberculosis in India, the Philippines, Russia, and South Africa: a mathematical modelling study. The Lancet Infectious Diseases, 17(7), 707–715. doi:10.1016/s1473-3099(17)30247-5就我国来说，尽管近年来结核病防控取得了显著成就，但形势仍不容乐观，据世界卫生组织统计， 中国每年新发结核病患者数量多达90万， 新发耐多药结核病患者 7万（2018年数据）。正如前文所说，我国是全球30个结核病高负担国家之一，活动性肺结核病人数居世界第二位。根据《2010年全国第五次结核病流行病学抽样调查报告》显示，我国结核疫情现状可以用四个“高”进行总结：感染率高（44.5%）、患病率高（367/10万）、耐药率高（18.6/10万）且死亡率高（9.8/10万）。多重耐药性结核病（MDR-TB）是指结核菌同时对两种最有效的第一线药物（利福平和异烟肼）具抗药性。某些情况下，还能出现广泛耐药性结核病，即对三种以上或六类最为有效的二线抗结核药物没有反应。
Treatment of Highly Drug-Resistant Pulmonary Tuberculosis. N Engl J Med. 2020 Mar 5;382(10):893-902.doi: 10.1056/NEJMoa1901814.该研究结果表明，接受治疗6个月后，BPaL方案的治疗成功率高达90%，显著高于此前其它治疗方法对于耐药结核病患者的治疗成功率，虽然存在一些药物相关毒副作用，但可以通过减药或换药等措施及时进行干预。目前美国食品药品监督管理局FDA已批准BPaL方案在美国使用，用于治疗广泛耐药结核病（XDR-TB）或药物不耐受或无反应性耐多药结核病（MDR-TB）。
Treatment of Highly Drug-Resistant Pulmonary Tuberculosis. N Engl J Med. 2020 Mar 5;382(10):893-902.doi: 10.1056/NEJMoa1901814对于耐药性肺结核，新药的生产无疑给了人们一些希望，但在现有情况下，如果可以明确治疗终点时间，就可以大幅降低耐药性肺结核患者的治疗时间。在2019年的一项新研究中，加州大学洛杉矶分校戴维·格芬医学院团队报告称，可以通过使用一种名为“人工智能-抛物线反应面”的方法来大大减少耐药性肺结核治疗时间。众所周知，各个药物的协同作用比其各自效力的总和更有效，此数据分析方法就是确定哪些药物组合可以协同工作。研究人员在数十亿种可能的药物和剂量组合中快速识别三种或四种药物组合，从而显著缩短了TB治疗的持续时间。这些方案既适用于药物敏感性结核病，也适用于大多数耐药结核病，并且比目前的标准治疗速度快五倍。需要提出的是，该方法仅用于细胞培养以及结核病小鼠模型，尚无人类试验。
