推荐：江舜尧
编译：小菌菌
编辑：小菌菌
香港中文大学黄秀娟，陈基湘等人近期在Gastroenterology杂志上发表了《Alterations in Gut Microbiota of Patients With COVID-19 During Time of Hospitalization》的文章，该研究探究了COVID-19患者住院期间肠道菌群的变化。
文章摘要
背景与目的:虽然SARS-CoV-2感染胃肠道组织，但很少有人知道肠道共菌在感染易感性和严重程度方面的作用。本文研究了住院期间SARS-CoV-2感染患者粪便微生物组的变化，以及与病毒严重程度和粪便中脱落的病毒的关系。方法：我们对2020年2月5日至3月17日在香港的15名COVID-19患者的粪便样本进行宏基因组测序分析。从入院至出院，每周收集粪便2 - 3次;疾病分为轻度(无肺炎的影像学证据)、中度(有肺炎)、严重(呼吸速率≥30/min或呼吸环境空气时氧饱和度≤93%)、严重(呼吸衰竭需要机械通气、休克或器官衰竭需要重症监护)。本文比较了6名社区获得性肺炎患者和15名健康个体(对照组)的微生物组数据，并且评估了肠道微生物组与疾病严重程度和粪便排出的SARS-CoV-2变化之间的关系。
结果：与对照组相比，COVID-19患者在住院期间和住院期间的所有时间点的粪便微生物群落发生了显著变化，其特征是机会性病原体的富集和有益共生物质的消耗。即使清除了SARS-CoV-2(通过咽拭子确定)并消除了呼吸道症状，耗尽的共生和肠道失调等现象仍然存在。Coprobacillus, Clostridium ramosum, and Clostridium hathewayi的基线丰度与COVID-19严重程度相关;抗炎菌Faecalibacterium prausnitzii的丰度与疾病严重程度呈负相关。住院期间，Bacteroides dorei、Bacteroides thetaiotaomicron、Bacteroides massiliensis、Bacteroides ovatus下调小鼠肠道ACE2表达，与患者粪便样本SARS-CoV-2负荷呈负相关。
结论：在一项对15名COVID-19患者的初步研究中，研究发现与对照组相比，住院期间粪便微生物组持续发生变化。粪便微生物群的改变与SARS-CoV-2和COVID-19严重程度相关。通过改变肠道菌群可能会降低疾病的严重程度。
文中重要图片说明
图1 粪便标本采集示意图，SARS-CoV-2 PCR检测结果及COVID-19患者住院时间(n=15)
图2 COVID-19患者疾病过程中肠道微生物组的变化
图3 疾病过程中COVID-19患者肠道细菌与粪便中脱落的SARS-CoV-2的关系
图4 COVID-19肠道微生物群改变示意图
你可能还喜欢
2019年度回顾 | 微生态环境微生物类微文大合辑
2019年度回顾 | 微生态人体/动物微生物类微文大合辑
2019年度回顾 | 技术贴合辑大放送
