文献解读 | 血清中三种miRNAs联合检测作为HNSCC的有效诊断生物标志物
论文：Combined identification of three miRNAs in serum as effective diagnostic biomarkers for HNSCC（血清中三种miRNAs联合检测作为HNSCC的有效诊断生物标志物）
摘要
背景：头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是一种发病率高、死亡率高的灾难性疾病。本研究旨在探讨HNSCC的有效诊断和预后生物标志物。
方法：从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中对HNSCC的miRNA表达数据及相应的临床资料进行综合分析，以确定具有诊断和预后能力的miRNAs。
分析了三种miRNA组合对不同分类的预测能力.然后对临床患者的诊断和预后价值进行评估和验证。
调查结果：在TCGA数据集中鉴定出HNSCC组织中有128个差异表达的miRNAs，最后筛选出10个miRNAs进行进一步研究。
分类分析发现hsa-mir-383、hsa-mir-615和hsa-mir-877的三miRNA信号具有最佳诊断能力，并在验证患者中得到验证。
生存分析表明，hsa-mir-383的不同表达水平，而不是hsa-mir-615或hsa-mir-877的表达水平差异显著。此外，多因素Cox风险分析表明，在验证患者中，microRNA信号对独立于其他临床变量的临床结果有统计学意义。
引言
头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是一组恶性肿瘤，主要来源于口腔、鼻腔、口咽、下咽和喉部，是全球第六大恶性肿瘤，死亡率高。据统计，全世界每年有超过65万例新病例出现，35万例死于HNSCC。
尽管近年来在外科技术、放射化疗和系统药物治疗等方面取得了进展，但HNSCC患者的5年生存率仍未得到明显改善。在大约42%的患者中，肿瘤在诊断时已经发展到晚期，有广泛的淋巴管浸润或远处转移。治疗失败，术后复发率高，预后差。
因此，必须探索更有效的诊断和预后生物标志物，以优化HNSCC的管理。
TCGA数据库中HNSCC患者miRNAs的差异表达
从TCGA数据库中采集了486个HNSCC样本和44个正常样本，每个数据库检测到1046个miRNAs。根据Wilcoxon试验的差异分析，我们发现在hnscc组织中有128个miRNAs表达与正常组织有显着性差异。
通过将miRNAs按照它们的P值然后，从128组中进一步筛选出30个miRNAs，它们的差异表达更为显著。考虑到这30种miRNAs在HNSCC患者中的显著表达变化，它们在一定程度上可能参与HNSCC的发病。
根据我们先前的研究和其他作者的工作，我们从这30种更显著差异表达的miRNAs中选出了12种有希望进一步研究的miRNAs，包括上调miRNAs，即hsa-mir-383、hsa-mir-490、hsa-mir-488、hsa-mir-1912、hsa-mir-1251、hsa-mir-1265，以及下调的miRNAs，即hsa-mir-615、hsa-mir-1910、hsa-1305、hsa-mir-1254、hsa-mir-503和hsa-mir-877。
TCGA数据库中组织中三种miRNA组合的分类分析
在评价这10种miRNAs的诊断性能之前，首先利用TCGA数据库中的样本分析了肿瘤组织与正常组织的分类能力。到目前为止，还没有发现单一的miRNA具有显著的诊断价值，因此它们的协同作用受到了更多的关注。
我们每次从十个miRNAs中挑选出三个，并通过五倍交叉验证来评估它们的分类能力。所有120个组合依次测试，前30个组合列在表S3中。结果表明，hsa-mir-383、hsa-mir-615和hsa-mir-877三种miRNA组合的预测精度最好，平均AUC(曲线下面积)为99.4%。
讨论
然而，我们的相关分析与肿瘤的分期和分级未能提供支持信息。MIR-615和miR-877也通过多种机制在多种肿瘤中发挥抑癌作用。例如，mir-615通过靶向AKT 2相关的乳腺癌细胞周期进展信号通路来阻断肿瘤细胞的生长。
在非小细胞肺癌中，miR-615-3p通过抑制IGF2抑制肿瘤生长和转移。Mir-877通过调节eEF2K/eEF 2信号级联抑制肾癌细胞的增殖和迁移能力。
在本研究中，hsa-mir-615和hsa-mir-877在不同肿瘤级别的HNSCC组织中的显著表达变化也提示了它们在HNSCC进展中的潜在作用，需要在细胞实验中进一步研究。
总之，我们的研究开发了一个用于诊断HNSCC的三miRNA信号，并揭示了其中hsa-mir-383的预后价值。我们认为这三种miRNAs在HNSCC的发病机制中都起着重要作用，并且hsa-mir-383和hsa-mir-383与肿瘤分级之间存在着初步的相关性。然而，要阐明它们在HNSCC中的具体作用和机制，还有很长的路要走。
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