给你一个基因,利用数据挖掘能做什么?
假如帮你选好一个基因,利用数据挖掘能做什么?利用数据挖掘能做的比较多的就是表达数据,例如看看在肿瘤组织与正常组织之间是否有差异,表达与预后的相关性。
其实,我们还看看它的甲基化水平,看看平均甲基化程度在两种条件下是否有差异,查看甲基化与表达的相关性,再看看这个基因的位点与表达的相关性等等。
除了看看甲基化外,我们还可以看看SNP突变数据,看看表达与突变的相关性,表达与SNP位点的相关性等等
除了上面这些,还会有吗?当然还有的,例如看看这个基因表达与DNA拷贝数的相关性等等。
如果数据都很理想,把这些数据都用上,发SCI绝对是妥妥的。当然,只一部分是漂亮的,都是妥妥的。
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