数据库数据 | TCGA数据库33种癌症的 transcriptome profiling (RNA-Seq) 数据
该数据是我自己下载整理过的数据。
下载日期：2021年7月12日
下载方式：TCGAbiolinks包
数据类型：RData
变量名称：expDataTPM
> ##加载数据，数据对象是一个数据框，变量名称是：expDataTPM> load("processedTCGAdata/TCGA-RNASeq-TPM/TCGA-ACC_RNASeq_TPM.RData")> head(expDataTPM)[,1:3] TCGA-OR-A5JJ-01A-11R-A29S-07 TCGA-OR-A5LT-01A-11R-A29S-07 TCGA-OR-A5LH-01A-11R-A29S-07TSPAN6 57.83159172 64.883481 13.1920993TNMD 0.05062098 0.000000 0.6890431DPM1 321.27250899 148.384435 114.2315919SCYL3 6.57160741 6.687236 7.3564339C1orf112 2.54046551 3.105887 1.5935638FGR 2.83865069 2.317543 2.1897053后台回复：TCGA-RNASeq，下载。
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一.Linux笔记
Linux笔记【002】| 远程登录服务器软件：MobXterm与FileZilla
Linux笔记【003】| Linux系统目录结构与基本命令
Linux笔记【011】| 腾讯CentOS云服务器挂载云硬盘与硬盘分区
二.R语言语法基础
第03章：R中的数据
三.R绘图笔记
02. R绘图笔记 | 一般的散点图绘制
03. R绘图笔记 | 柱状图绘制
07. R绘图笔记 | 箱形图的绘制
10. R绘图笔记 | 热图的绘制
11. R绘图笔记 | 生存曲线的绘制
12. R绘图笔记 | 火山图的绘制
13. R语言数据可视化——解读ggplot2绘图思想视频教程
14. R绘图笔记 | 词云图的绘制
15. R绘图笔记 | GO-BP，GO-MF，GO-CC绘制在同一个柱状图中
四.R与统计
第3章:R语言绘图基础(看上一部分文章)
五.文献笔记
001.HOXC11作为一种新的致癌基因在人结肠癌和肾透明细胞癌中发挥作用
002.在基底细胞样乳腺癌中，ANXA4通过与ANXA1相互作用激活JAK-STAT3信号通路
003.ANXA8在胃癌中的预后价值
005.KLF7:高级别浆液性卵巢癌新的候选生物标志物和治疗靶点
六.分子对接
06. 分子对接教程 | (6) AutoDock对接操作与对接结果解读
07. 分子对接教程 | (7) AutoDock对接中易错问题
七.生信在线分析工具
001. 生信工具 | TCGA数据分析工具GEPIA最新更新，用于免疫细胞浸润分析
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