这些年很火的m6A甲基化,到底都在研究些什么登西……
m6A的RNA甲基化,应该是最近还算是比较火的课题
,但这实际上并不是什么新生课题方向,早在40多年前,就已经有这课题了。夏老师今天,
就给你们夏季把讲讲什么是m6A的甲基化。
实际上m6A就是腺苷的N6位这个位置上的甲基化修饰
,在mRNA中,这样的修饰很普遍。
夏老师能翻到的最早的报道,是1974年的一篇PNAS,分析了一下肝癌细胞的甲基化核苷:
这篇文章就用了同位素标记的甲基,用DEAE-纤维素(硼酸盐)色谱法来对片段化的mRNA进行分析,成功地发现了mRNA上有甲基化的现象……(不知道献祭了多少研究生的肝脏
)
可能当时就这样,mRNA的甲基化,就突然变成了重点,隔年,也就是1975年,针对mRNA的甲基化,
分别发表了一篇Nature:
和一篇Cell
:
基本上这两篇文献,说明了mRNA的甲基化,
在5`端是比较常见的一种修饰,可能有比较大的功能和作用。
接下去,问题就来了,
是什么给这些RNA进行甲基化修饰的呢?于是大家就开始研究RNA甲基化酶
,要等到1997年,
才克隆到了m6A的甲基化酶。
当然,这也不难理解,当时PCR刚兴起没多久,就随便克隆个基因都是能博士毕业的。也不难发现
,这本杂志IF并不高,因为1975年火完后,
就慢慢搁置了。甲基化酶发现后
,隔了蛮多年,到2010年,发现这些RNA的甲基化都是可逆的
,于是在2013年研究肥胖基因FTO的同时,
发现它主要功能是RNA的脱甲基化酶。甲基化酶负责写入,脱甲基化酶负责擦除:
那修饰完,总要有功能吧
,于是就又出现了m6A甲基化RNA的结合蛋白:
对于甲基化修饰的RNA结合
,并辅助翻译、降解等功能。
也就到这几年,
差不m6A修饰的研究才基本定型。那m6A研究的技术又是什么样的呢
?
虽然,1975年刚开始研究RNA甲基化修饰的时候
,酶联免疫还是最新技术,没怎么应用,测序法都是两年后的事情,Mullis还在他自己开的面包店里考虑博后怎么出站(他没发明PCR之前,写过小说,
博后期间还开过两年面包店,
谁没有个过去呢),所以当时研究m6A甲基化的技术,现在看起来很渣,
差不多就是衍生版的Northern Blot。
先把mRNA打碎
,然后电泳,或者色谱来分析
,就像这样:
单向的电泳要是不够
,那就来双向的电泳:
和现在研究m6A的方法比起来
,以前的图
…………真的是…………真的是好看得多。
由于现在大量使用的是m6A抗体结合的方法
,来进行研究,常见的就是甲基化的ELISA,
所以你在文献里看到的m6A研究的图可能就是这样:
当然,在抗体结合m6A修饰的RNA后
,还能通过测序进行分析,这就是MeRIP-Seq,当然,测序后的验证,也是用MeRIP-PCR完成的,
所以最终的验证图可能还是:
当然,还有类似用抗体或者别的化学方法
,去阻碍m6A修饰的碱基逆转录,然后二代测序的方法等等……就看你们花不花得起钱和发际线了
……好了,要看这几篇早期的m6A文章或者m6A研究技术的文章的话,就回复“公克”(不要在评论区回复
),今天就先策到这里吧,祝你们心明
眼亮
。
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