生信基础知识100讲

数据库专题

  1. 一文看懂NCBI的refseq

  2. 浅谈Entrez ID

  3. 带你认识GEO数据库

  4. NCBI数据库专题之Taxonomy

  5. 基础数据库之dbSNP

  6. pubmed

  7. OMIM数据库

  8. Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同

基础概念专题

  1. 浅谈RPKM,FPKM,RPM,TPM的区别

  2. 二代测序的barcode/index

  3. De Novo sequencing vs resequencing

  4. 浅谈FastQ和FastA格式

  5. NGS基础概念-depth and coverage

  6. 名词package

  7. paired-end Reads

中心法则专题

  1. 中心法则-DNA

  2. 中心法则-RNA

  3. 中心法则-蛋白质

  4. DNA复制

  5. NGS与转录

  6. 中心法则之翻译

  7. 逆转录

测序平台专题

1.Sanger测序

2.illumina测序

3.罗氏454测序

4.SOLiD测序

5.Ion Torrent测序

6.pacbio测序

7.纳米孔测序

数据格式专题

1.FastQ和FastA格式

2.SAM格式

3.gff/gtf格式

4.Bigwig/Wiggle格式

5.bed格式

6.vcf格式

7.Blast&Blat

测序数据质量控制专题

1.测序数据质量控制之FastQC

2.测序数据质量控制之cutadapt

3.测序数据质量控制之sickle

4.测序数据质量控制之Trimmomatic

5.测序数据质量控制之fastx Toolkit

6.测序数据质量控制之RSeQC

7.测序数据质量控制之CHIPQC

组学专题

1.组学专题-基因组学

2.组学专题-转录组学

3.组学专题-表观基因组学

4.组学专题-微生物组学

5.组学专题-蛋白质组学

6.组学专题-代谢组学

变异形式专题

1.变异形式专题-参考基因组

2.变异形式专题-基因结构

3.变异形式专题-SNP多肽性

4.变异形式专题-SNV

5.变异形式专题-CNV

6.变异形式专题-SV

7.变异形式专题-INDEL

遗传资源数据库专题

1.遗传资源数据库专题-1000genomes

2.遗传资源数据库专题-hapmap

3.遗传资源数据库专题-EXAC

4.遗传资源数据库专题-ESP6500

5.遗传资源数据库专题-UK10K

6.遗传资源数据库专题-COSMIC

7.遗传资源数据库专题-TCGA

8.遗传资源数据库专题-gnomAD

转录组专题

转录组专题-可变剪接

转录组专题-融合基因

转录组专题-WGCNA分析

转录组专题-变异位点

转录组专题-芯片异同

转录组专题-GTEx

转录组专题-BodyMap

功能数据库专题

功能数据库专题-GO

功能数据库专题-KEGG

功能数据库专题-BIOCARTA

功能数据库专题-reactom

功能数据库专题-DAVID

功能数据库专题-GSEA

学习资源分享专题

学习资源分享专题-国内外几十个生信课程带你飞

学习资源分享专题-数据分析与R语言

学习资源分享专题-带你快速入门高通量测序

学习资源分享专题-生信人windows电脑必装软件

学习资源分享专题-网络学习资源-MOOC

学习资源分享专题-生信入门

帮助更多人更好的入门生物信息学一直是我做分享的初衷，博客也好，论坛也罢，还有现在流行的微信公众号都只是一个表现形式。渐渐地生物信息学数据处理业界第一大号，几万粉丝，过百学员及VIP合作伙伴这些包袱束缚了我，无法在生信技能树这个平台过多的涉及过于基础的知识点，我们和其它平台很大的区别就是从来不会缺远程教程，但是过去的一年做的实在是太优秀了，迫不及待的把所有精华知识分享给了一起进步的小伙伴。导致未来的教程想超过过去的表现真的很难，而关注我们的人不断有涌来，各种知识背景，基础的人都有，如果我们一直发布高质量，操作门槛高的教程又对他们不住，思来想去就重操过往生信菜鸟团大旗，带领一般爱智求真的小伙伴一起为大家铺设入门的康庄大道。

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