nestin-cre小鼠鉴定问题
下图为JAX实验室的方法,但是我按照这个PCR条件,琼脂糖电泳后没有条带,然后我调整了一下PCR 条件,94℃20s,60℃15s,72℃30s,35个循环,跑出来只有150或者246的单条带,没有246、150两条带出现的情况。
小鼠为杂合子
1)是否我的小鼠基因组提取有问题?此次的DNA浓度为400ng/ul左右
基因组DNA提取:
1) 剪鼠尾0.3-0.5cm到新的离心管,一一对应编号。
2) 每离心管加入200ulPBND+PK2ul, 56度水浴锅过夜。PBND为鼠尾消化液(50mM KCl, 10mM Tris-HCl, 2.5mM MgCl2, 0.45% (v/v) NP-40 and 0.45% (v/v) Tween-20),PK为蛋白酶K
3) 95度水浴5min,灭活蛋白酶K平衡至室温,将离心管剧烈振荡,13000rpm,离心15分钟。
4) 取上清到新的离心管,加入等体积的异丙醇,待DNA析出,13000rpm离心10分钟,弃上清。
5) 用预冷的75%乙醇洗涤沉淀一次,1200rpm离心5分钟,将上清全部吸弃。
6) 在超净台中风干约3-5分钟,加入100ul灭菌水,在55℃溶解2小时即可作为PCR模板。
2)我的PCR 条件有问题吗?
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