线粒体蛋白的内参蛋白选择原则
1) VDAC1 /孔蛋白
电压依赖性阴离子通道(VDCA)是一类孔蛋白家族蛋白,是真核细胞中线粒体外膜的主要蛋白。脊椎动物中至少有三个成员(VDAC1,VDAC2和VDAC3)。VDAC1存在于线粒体外膜和质膜中,在每个位置发挥不同的功能。它在心脏,肝脏和肌肉组织中表达。由于存在可变剪接,因此存在VDAC1的多个变体。 VDAC1基因在黑猩猩,狗,牛,小鼠,大鼠,鸡和斑马鱼中是保守的。人VDAC1与小鼠同源物具有99%的同一性,与斑马鱼同源物具有85%的同一性。
2) 细胞色素C氧化酶/ COX4I1
线粒体内膜中的细胞色素C氧化酶是线粒体电子传输链的最后一个酶复合物。该复合物由线粒体和核基因编码的13个亚基组成。细胞色素C氧化酶的亚基IV具有两个同工型(同工型1和2)。它们由两个核基因(COX4I1和COX4I2)编码。亚型1在肺组织中普遍表达,而亚型2在肺组织中高度表达。 Isoform I COX4I1通常用作上样对照。人COX4I1与小鼠同源物具有80%的同一性,与其斑马鱼同源物具有63%的同一性,与人COX4I2具有60%的同一性。
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