IVIM-MRI免费开源软件汇总（体素内不相干运动-扩散加权成像）

我爱工作

一直以来都想总结一下目前市面上能找到的IVIM-MRI开源软件的介绍，为各位影像科医生选择IVIM-MRI软件提供帮助。因为工作繁忙，一直没找到合适的时间。今天是2020农历新年假期的最后一天，我想，还是要抽出时间来写了。不然，当2021年一晃而过的时候，发现年初立的flag依然没有实现，对不起辛苦在科研一线的医生战友们。

在前面的帖子中，我们陆续介绍了QSM, R2star, DKI数据后处理软件的使用（可查询本公众号历史文章），相比于这些应用，IVIM-MRI的应用更加广泛（虽然大师兄觉得这个很low了，真的用了太多年了，但还是会被很多劳苦大众询问^ - ^），从曾经的大三甲医院深入到如今的地级市医院（应该还没到县级医院吧，有的话请加大师兄微信告知，刷新一下大师兄的科研认知）。

关于IVIM-MRI的具体技术和临床应用，大师兄在这里就不去讲了，文献还是比较多，可以自行查询。这里重点看一下IVIM-MRI技术发明人2019年在neuroimage上发表的一篇review，重点回顾了一下这么多年IVIM-MRI技术发展的历史以及IVIM-MRI究竟能给我们带来什么价值。

具体到IVIM-MRI的开源软件，可以大致分为三类：

1、第一类是商业软件，比如GPUS等各大厂家提供的科研工作站；或者第三方小公司提供的软件（其实这些软件也都没有经过FDA/CFDA认证，跟开源软件没有区别）；

2、第二类是以源代码形式提供的开源软件，这类因为没有可视化的界面，不太适合医生使用，但是非常适合工程背景的人使用。这里重点推荐一下两个python库, 均含IVIM模型：

DIYP: https://github.com/dipy/dipy

DMIPY: https://github.com/AthenaEPI/dmipy

3、第三类是以UI界面形式呈现出来的开源软件，这里我们推荐三款软件。

第一款：由国内vision tech公司开发的软件，非常好用，简单易学，并且是window版本。缺点就是需要申请，有一定的时间限制，遇到软件升级调整的话，软件可能会暂时失效（当然，他们也提供收费版本的，收费版本的服务肯定会好很多）。

软件申请网站：http://www.vusion.com.cn/?page_id=14971

第二款：由纽约大学医学院放射学系的Artem Mikheev和Henry Rusinek开发的FireVoxel.  FireVoxel是基于Windows的研究软件包，用于显示和分析MRI，CT，PET和SPECT图像，里面包含有IVIM-MRI分析功能。缺点是，该软件也需要申请到key来使用，每个电脑有单独的ID.

软件申请网站：https://www.firevoxel.org/

第三款：由德国癌症研究中心（DKFZ）开发的MITK（The Medical Imaging Interaction Toolkit医学影像交互工具包），是一款免费开源软件，用于供Medical Imaging Interaction的研究，已开放全球数千人使用。这也是大师兄最喜欢的一款，横跨Windows, Mac, Linux三大软件平台。

老外做研究特别喜欢回顾自己的光荣历史，这不，PubMed查询了一下文献，这个团队在2013年的时候发表了一篇文章，回顾了一下10年的开发历史。今年2021年，这样算下来，快接近20年了。德国人向来以严谨著称，一个工作坚持近20年，并且一直在发展，相当不容易。和上述提到的软件相比，MITK无论是在权威性，开放性，还是持续性上，都具有碾压性的优势。只是在安装上，可能会遇到一点小麻烦，但是只要成功安装，以后用起来就会很爽。

软件申请网站：

https://github.com/MIC-DKFZ/MITK-Diffusion#Downloads

https://www.mitk.org/wiki/Downloads#MITK_Diffusion