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宏基因组功能分析选择基于reads分析还是基于组装分析？一直以来都是大家争论的问题。鱼与熊掌是否能兼得呢？微科盟两种分析都可以提供，老师们可以根据自己的倾向选择一种或者两种都做，选择合适的结果进行下一步的研究。这两者的区别是怎样的呢？根据我们的分析结果，区别如下表，希望能对老师在选择方面有一定的帮助。
两种分析区别
基于reads的功能分析，是我们目前默认的分析流程，分析速度会比基于组装的分析快2-3倍，准确性也更高，有差异基因物种来源分析，可以做EC 酶库注释，Metacyc代谢通路注释，但是没有物种注释和功能注释文件。基于组装的分析，可以提供物种注释结果文件和功能注释结果文件，但是没有差异基因物种来源分析结果，分析周期比基于reads慢2-3倍。如果您希望分析速度快且有物种来源分析，请选择基于reads分析。如果不需要物种来源，对分析周期不着急，关注物种和功能注释结果文件，请选择基于组装。如果您需要两种，那就一起都分析吧。第二种分析我们仅收取纯分析一半的费用奥。欢迎咨询微科盟组学老师。
