二代测序方法列入首部《中国非小细胞肺癌RET基因融合临床检测专家共识》强烈推荐范围

近日,中国首部《中国非小细胞肺癌RET基因融合临床检测专家共识》(以下简称“共识”)正式发布。“共识”的发布顺应精准诊疗发展大背景,为中国受体酪氨酸激酶RET(Rearranged during Transfection)基因融合临床检测的规范化奠定了基础。

作为驱动癌症产生的“始因”之一,携带某些融合基因/剪切变异的患者相关靶向药预后较好,使得相关变异事件的有效检出深受临床重视。

在推荐的检测方法中,二代基因测序方法(next generation sequencing,NGS)被“共识”列入强烈推荐范围——DNA二代测序方法纳入RET检测「強烈推荐」等级,RNA二代测序方法也备受认可获「推荐」

中国非小细胞肺癌精准治疗新篇章:

迎来首个获批的RET抑制剂

2021年3月24日,因优越和持久的临床抗肿瘤活性且耐受性和安全性良好,国家药品监督管理局(NMPA)通过优先审评审批程序附条件批准RET抑制剂普拉替尼胶囊(pralsetinib,商品名:普吉华)上市,用于既往接受过含铂化疗的RET基因融合阳性的局部晚期或转移性非小细胞肺癌(NSCLC)成人患者的治疗。

该药品上市意味着中国迎来了首个RET抑制剂,为局部晚期或转移性NSCLC成人患者提供了新的治疗选择,也打开了中国NSCLC精准治疗的“RET抑制剂新篇章”。

2020年6月,燃石医学与基石药业达成伴随诊断(CDx)战略合作,双方携手开发和商业化普拉替尼在中国地区的CDx伴随诊断, 用于检测肿瘤患者的RET基因变异。

RET基因融合变异和激活突变是NSCLC和甲状腺髓样癌(MTC)等多个癌种中重要的肿瘤驱动基因变异。此外,肉瘤、结直肠癌、胆管癌和卵巢癌等癌种中也检出了较低频率的RET融合。

二代测序方法获「強烈推荐」

“共识”指出,准确检测RET基因融合是实施RET抑制剂治疗的前提。在目前体外诊断检测技术的不断涌现和更新,以及RET抑制剂靶向药物获批的背景下,规范检测出这些携带RET基因融合突变的NSCLC患者,就成为了目前临床和病理检测的当务之急。

在众多伴随诊断的技术平台中,相比于传统检测方法,二代基因测序(NGS)具有高通量、高灵活性的特点:

  • DNA-seq可以有效检出全部的基因变异形式(突变、插入、缺失、融合)以及免疫标记物MSI、TMB,满足了癌症患者靶向和免疫治疗、动态监控疾病进展等临床个性化精准全程管理需求;

  • 在融合/剪切突变方面,RNA-seq也拥有着得天独厚的优势:①融合/剪切突变直接检测RNA,可避免由于DNA-seq无法覆盖内含子导致的漏检;②融合/剪切突变往往有RNA或蛋白产物表达,RNA-Seq可验证融合是否有表达,更接近功能检测。基于RNA-seq因更灵敏更直接,同时验证功能,已经被多个肿瘤指南/共识推荐用于融合基因的检测。

“共识”中,非小细胞肺癌RET基因融合检测常见方法比较及推荐级别

因NGS技术方面的优势,“共识”「強烈推荐」基于DNA的二代测序适用于同时检测多个基因的多种已知或未知变异类型;「推荐」基因RNA的二代测序适用于同时检测多种融合基因

燃石OncoScreen Mate:

融二为一,MATE相伴

随着癌症患者可用药靶点的不断发现、研究和药物上市,临床对患者DNA和RNA综合分析需求正不断增长。RNA-seq检测融合基因的“专而精”结合DNA-seq检测各种变异类型的“广而精”,将克服融合/剪切变异检测挑战,帮助癌症患者准确检出所有用药相关的变异类型,全面匹配精准治疗方案。

燃石医学内部数据库显示,肺癌中常见融合/剪切变异可用药靶点总发生率达到约15%,ALK、ROS1、MET14 外显子跳跃突变、RET、NTRK、FGFR、NRG1等基因融合位点的检出将为癌症患者提供更多临床获益的机会。

燃石医学基于全球领先的NGS检测技术,已上市了实体瘤患者DNA+RNA双检测产品OncoScreen Mate。

OncoScreen Mate融二为一,DNA+RNA同时提取,结合双端UMI矫正,做到基因全长均匀扩增,并结合燃石自主研发的融合算法markSV,增强重排检测灵敏度。

  • DNA层面:覆盖各类型实体瘤的靶向用药指导、遗传易感筛查等的同时,报告TMB/MSI等指标,做到免疫靶向全面筛查;

  • RNA层面:全面覆盖常见融合/易位/可变剪切相关基因,全转录本覆盖;当样品中发生融合/剪接变异的RNA低至3拷贝/ng时仍可稳定检出,性能验证显示敏感性和特异性均达到100%。

燃石医学内部数据分析显示:

OncoScreen Mate额外检出可靶向变异8.4%,可显著提升患者获益

OncoScreen Mate为精准检测包括RET基因融合在内的所有用药相关变异类型提供了有力的检测手段,将助力于更多患者在精准治疗中延长生存、提高生活质量。

关于燃石

燃石医学(纳斯达克代码:BNR)成立于2014年,公司使命为“用科学守护生命之光”,专注于为肿瘤精准医疗提供具有临床价值的二代基因测序(NGS)。公司业务及研发方向主要覆盖:1)基于NGS的肿瘤患病人群检测,累计检测样本超过27万例,在中国拥有领先的市场份额;2)基于NGS的癌症早检,目前已经进入临床验证阶段。燃石医学于2018年7月获国家药品监督管理局(NMPA)颁发的中国肿瘤NGS检测试剂盒第一证,在体外诊断领域具有里程碑式意义。位于中国广州的实验室通过广东省临检中心颁发的“高通量测序实验室”技术审核,获得美国CLIA和CAP实验室质量体系资质认证;位于美国加利福尼亚州的实验室也已获得CLIA和CAP实验室质量体系资质认证。公司将继续致力于开发创新可靠的NGS检测产品,推动肿瘤精准医疗领域的发展。

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