2021.04在线数据库汇总
在4月期间,总共发表了医学相关在线数据库34个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据库。如果想要所有相关数据库信息的,后台回复:2104。
疾病和药物相关数据库
在这个部分,一共发表了4个数据库。其中两个基因和疾病相关的数据库。
其中, GPCards是一个在基因组水平分析基因和疾病相关性的数据库。通过数据相对应的基因组信息。就可以查询信息内的基因哪些和疾病有关。
微生物和病毒相关数据库
在这个部分,总共发表了1个数据库。这个数据库主要收集了病毒当中circRNA的信息。对于研究病毒方面的而言,如果把病毒circRNA当作一个研究对象也是一个创新点的。
在这个数据库当中,包含了来自26种病毒的46,440种病毒circRNA。
DNA相关数据库
在这个部分,总共发表了6个和DNA有关的数据库。
其中, CanDriS是一个肿瘤驱动基因查询数据库。这个数据库使用TCGA、ICGC数据库的数据利用多种不同的算法来预测肿瘤相关驱动基因。在数据库当中,我们可以预测肿瘤相关驱动基因,也可以预测耐药相关驱动基因。
RNA相关数据库
在这个部分,总共发表了7个数据库。
其中 TRlnc是一个用来预测lncRNA调控作用的数据库。这个数据库的团队之前也发表了很多关于转录调控的数据库,例如我们之前介绍的:KnockTF、SEanalysis。
蛋白相关数据库
在和蛋白相关的数据库当中,总共发表了7个相关的数据库。有兴趣的可以自己了解一下。
其中 HLA Ligand Atlas 是一个查询正常组织当中HLA配体的数据库。在这个数据库当中,作者从227个良性人体组织样本中首次广泛收集的成对的HLA-I和HLA-II免疫肽。这样获得的HLA配体信息,比相较于肿瘤癌旁正常的组织更加准确。
流程化分析数据库
在这个部分,这个月发表了3个数据库。包括多个组学的数据分析。
其他方面数据库
在3月份其他方面一共发表了3个数据库。
其中 MegaGO是用来比较两组GO分析结果相似性的网站。经常我们在进行不同分组的GO富集分析的时候,会得到不同的GO的结果。但是这些结果是否相似,很难进行比较了。这个数据库则是可以在输入两个不同的GO ID之后,比较出两者富集分析的相似性。