代谢组学是什么?
代谢组学是在基因组学、转录组学和蛋白质组学之后升起的系统生物学的一个新的平台,其定义为:定性、定量考察生物体系受到刺激或扰动后其代谢产物的动态变化,揭露机体生命代谢活动本质的科学。
代谢组学力求对生物样本中尽可能多甚至全部化合物进行检测,可以看到生物体内部的代谢状况。检测的化合物为分子量较小的代谢底物或代谢终产物,故其研究对象是代谢网络中相对分子质量小于1000×10^3的所有内源性代谢物。它不仅对生物标志物进行确认和功能分析,还需研究其参与的代谢反应、所处的代谢通路。
代谢组学的特点可以分为:系统性、整体性和动态性。完整的代谢组学研究步骤包括样品的制备、数据的采集和分析及潜在生物标志物的发现。
大量实验证明,单一的研究样本、检测技术以及数据处理方法,已无法满足代谢组学高通量、大规模的需求,“整合”技术便应运而生,形成了“整合化”代谢组学。已经实现的“整合”包括:
(1)研究样本的整合。如体液、组织及细胞等的整合;
(2)检测技术的整合。核磁共振与质谱及其联用技术是代谢组学研究中常用的分析技术,各有优劣。为了扬长避短,带有平行磁共振的液相色谱质谱技术的出现,构成了质谱与核磁共振在住线组合系统,它具备了3种检测技术的优势,能够提供综合的结构化数据,同改进后的新技术,如流动探头、液相色谱、在线固相提取物和磁共振一起被广泛用于从复杂生物样本中鉴定新的潜在的**;
(3)数据分析技术的整合。只有对原始数据进行深层次的挖掘,才能更地获取有生物学意义的标志物。常用的数据处理方法有主成分分析、偏小二乘法等。目前,通过大量的研究,数据的整合可以通过多种途径再不同水平上实现,并需要运用特殊的统计方法和多种模式识别方法;
4)组学间的整合。为了更好的发挥其系统性,可以通过与蛋白组学、转录组学及基因组学的整合,从不同角度更更系统地理解代谢物与蛋白表达基困变异之间的联系,终实现代谢组学的目标。代谢组学的发展促进整合化的发展,而整合化的发展同时促进了代谢组学的进步。目前,代谢组学已广泛应用十多种领域。