招募5个小伙伴,和我一起翻译WGCNA官方书籍

看到去年的优秀学员开启了自己的学习计划,非常欣慰,帮她广而告之,希望聚集更多的志同道合小伙伴组队学习!

下面是招募令

活动发起

WGCNA是生物信息分析基因共表达过程中绕不过的工具,同时也是我们入们和进阶基因共表达网络分析极好的学习范式。在技能树的本科生后备小队里,有很多同学对WGCNA的认识有很多的空缺,于是我找到原始书籍的pdf,在群里发起翻译活动,得到了健明老师的支持。

招募内容

因此我们将招募5个小伙伴,一起翻译史蒂夫·霍瓦斯(Steve Horvath)教授的《Weighted Network Analysis Applications in Genomics and Systems Biology》。全书主要内容一共450页,15个章节,以下是翻译版的部分目录。

具体要求如下:1. 乐于学习并愿意分享 2. 具有相关的实际分析经验优先  3. 具有一定的翻译经验优先

什么是WGCNA?

  1. 相关性网络在生物信息学的研究中被越来越多地使用。其中,加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA) 就是一 种描述基因与 基因间关联关系(共表达关系)的系统生物学算法。

  2. WGCNA被运用去寻找高相关性的基因模块(聚类),可以用模块特征或hub基因来概述该模块,并把该模块同其他模块或者你所感兴趣的性状指标关联来阐释你的科学假设。

  3. 相关性网络促进了依赖网络分析的生物标志物和疾病靶点筛选。该分析已经成功地运用到很多生物学研究中,例如肿瘤,小鼠组学,酵母组学研究中。

  4. WGCNA R软件包是综合了各种R函数,用于执行加权基因共表达网络分析。该软件包包括网络构建、模块鉴定、hub基因筛选、网络拓扑结构属性计算、网络可视化等功能。

Form:https://ph.ucla.edu/news/publication/weighted-network-analysis-applications-genomics-and-systems-biology

史蒂夫·霍瓦斯(Steve Horvath)介绍

是加州大学洛杉矶分校的人类遗传学和生物统计学教授。研究领域是生物统计学,生物信息学,计算生物学,癌症研究,遗传学,流行病学,机器学习和系统生物学的交叉领域。课题组将这些方法应用于各种疾病的研究,例如衰老研究,癌症,心血管疾病,HIV,亨廷顿舞蹈病,神经退行性疾病。

系统生物学和系统遗传学:我的小组开发并应用了分析和整合基因表达,DNA甲基化,microRNA,遗传标记和复杂表型数据的方法。特别是,我们开发了加权相关网络分析(也称为加权基因共表达网络分析WGCNA),这是一种用于分析高维“组学”数据的系统生物学数据分析方法。这些方法还有助于在基因组水平上比较不同物种。您可以在http://labs.genetics.ucla.edu/horvath/htdocs/CoexpressionNetwork/上找到许多资料,包括文章,R软件教程和youtube讲座。

报名渠道

(0)

相关推荐

  • 非肿瘤疾病怎么和m6A扯上关系?

    导语 今天和大家分享的是2020年3月份发表在Ann Transl Med杂志上的一篇文章(IF=3.297)"Contribution of m6A subtype classificat ...

  • 非肿瘤易学的2+分方案

    您的SCI选刊助手!今天给大家分享的是一篇2+分的学习笔记.这篇学习笔记通过差异表达基因(DEGs)筛选.加权共表达网络分析(WGCNA).GO和KEGG富集分析.PPI网络分析确定枢纽基因.验证枢纽 ...

  • 有没有懂眉语的小伙伴?出来翻译一下啊!

    还不容易迎来了全明星假期,老詹也去了国外度过了短暂的三天假期回来来放松身体,准备来启动二月詹模式. 作为联盟的金字招牌,老詹当然是媒体们的焦点,此次老詹接受采访,球馆也被记者们围得水泄不通. 当记者问 ...

  • 【读书群招募】2017年和我一起用阅读丈量时间

    我在2016年3月份组织了英语原版书读书群,到现在已经有了10期,到今年年末,我们一同读了21本原版书,什么类型的都有,一起用阅读丈量时间. 2016读书群读书笔记 How to Read a Boo ...

  • 我和我的小伙伴都惊呆了,居然有人因为防腐剂不敢喝雪碧?

    随着生活质量的提高,人们对食品的要求也越来越高,食品卫生和食品安全时刻牵动人心.很多人说,有添加的食品就不健康绝对不要吃,有添加的饮料也不能喝,就连小编最喜欢的雪碧仅仅因为添加了防腐剂就被黑上榜.小编 ...

  • 我和我的小伙伴们的童年

    我和我的小伙伴们的童年 (怀念1950年到1965年武汉高级步兵学校的小伙伴们) 日子过着过着我们就成爷爷奶奶了,如今每天的任务之一就是到幼儿园去接孙子.时间过得真快呀,一晃60年过去了.当我两鬓白发 ...

  • 我和我的小伙伴

    我是丙火日,从小到大我都喜欢跟壬水玩,小的时候我不懂,后来学习了才发现,原来让我念念不忘的都是壬水.

  • 一起葡萄吧又招募小伙伴了

    不知不觉  "一起葡萄吧"  成立一周年了, 这一年,进群的网友已经217人,大家在群里交流葡萄种植技术,共同探讨未来葡萄产业的发展方向. 这一年,我又做了今日头条,用了半年的时间 ...

  • 我和我的小伙伴都惊呆了:痛风竟然是人类进化的结果?!

    近年来,随着人们生活水平的提高,痛风已经成为我国仅次于糖尿病的第二大代谢性疾病.摄入的嘌呤含量过高往往会引发痛风,以至于现在,只要说起海鲜啤酒,就有人把它们和"痛风套餐"联系在一起 ...

  • 我和我的右膝盖做沟通——小伙伴投稿

    之一 纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行 前段时间,看小伙伴的投稿,写到关于可以用意识疏通和按摩身心,还有直接放下情绪,看的时候,我很有感悟,但是始终没有亲自实践. 昨天下午做破除练习时,右膝盖处不时泛起 ...