使用R语言展示我们生信技能树全国巡讲的征程

jimmy

期待在你的城市见到你!

话说有那么一天。全能打杂·小洁需要写一个全国巡讲推广软文,打开原来的推文看到这样一个路径图

(之前做的,但是忘记该怎么做了)

两个月过去了,又去了几个城市,图该更新了,这可咋办。向来不喜欢走回头路,于是就另寻他法了。
胡乱搜索一下,发现R语言可以做

直接上代码

0.准备R包

if(!require(devtools)) install.packages("devtools")
library(devtools)
if(!require("REmap")) install_github('lchiffon/REmap')
library(REmap)

1.以珠海为起点的足迹图

options(remap.js.web=T) 
destination<- c("重庆","济南","北京","北京","广州","上海",
                "郑州","西安","武汉","成都","珠海","北京","杭州","长春")
origin <- rep("珠海",times=length(destination))

map_data<- data.frame(origin,destination) 
map_out1<- remap(mapdata=map_data,        
                 title ="全国巡讲足迹",
                 subtitle ="生信技能树",
                 theme =get_theme(theme='Dark')
)
plot(map_out1)  

超燃的!动态的!交互式的!

2.首尾相连的路径图

origin<-  c("珠海","重庆","济南","北京","北京","广州","上海",
            "郑州","西安","武汉","成都","珠海","北京","杭州","长春")

#终点数据:
destination<- c(origin[2:length(origin)],origin[1])

map_data<- data.frame(origin,destination) 
map_out1<- remap(mapdata=map_data,        
                 title ="全国巡讲足迹",
                 subtitle ="生信技能树",
                 theme =get_theme(theme='Dark')
)
plot(map_out1)  

酷毙了好吗!不发朋友圈对的起自己吗?

3.热力图

heatmap = sampleData()
Citys<- data.frame(city = origin,prob=sample(heatmap$prob,length(destination),replace = T)) 
position<-get_geo_position(as.character(Citys$city )) #获取城市所在的经纬度
map_out1<-merge(position,Citys,by = "city")

remapH(title = "生信技能树全国巡讲",
       map_out1[,2:4],
       maptype = 'china',
       blurSize = 25, 
       minAlpha = 1) #数据包含3列即经度、维度、密度

这个是静态的,但也挺好看的~期待以后去更多城市,为了更美好的明天而奋斗!

4.常见问题

(1)R包安装问题

代码在windows上运行大多会遇到一个问题:

我上课是提倡不要更新的,除非一直报错。先选3(不更新),紧接着library(REmap)检验是否安装成功,不成功就重新安装选择1(更新全部)吧。

小郭同学测试过程中还遇到了这个:

这个报错我曾讲过如何处理,就是手动删除电脑上旧包的整个文件夹,然后重装

司命,记下来。这里有两个傻报错

如果你用mac 找不到安装路径,请看这里:

mac让你找不到路径

(2)经纬度不识别

有可能会出现这样一个warning:

警告信息:
1: In get_city_coord(out_list[i], ...) : Please use your own baidu API!
Set it using: options(remap.ak = "XXXXX")
http://lbsyun.baidu.com

然后画出这样的错误图:

就是经纬度识别错误了,可能是windows电脑本身的问题

测试了两个windows电脑,一个刚开始能运行,后来就不识别了。另一个更惨,直接就是出现这种不识别的图。

我的解决方案是:拿mac试试!(然后就成功了)反正不是代码的问题,API如何设置我没有搜到,放弃治疗了~

(0)

相关推荐

  • Vim中的remap,noremap,nnoremap和vnoremap映射命令之间有什么区别?

    是什么之间的区别remap,noremap,nnoremap并vnoremap在Vim的映射命令? remap是使映射递归工作的选项.默认情况下,它处于启用状态,我建议您采用这种方式.其余为映射命令, ...

  • 你的Windows触控板还在吃灰?学会这些技能,轻松告别鼠标

    你的Windows触控板还在吃灰?学会这些技能,轻松告别鼠标

  • 生信技能树-R语言视频课听后感 (10万+的播放量就看这个春节)

    应该是我自己的学徒就贡献了一半的学习量吧,距离我夸下海口的10万工程师相差甚远,所以非常有必要放一些导学笔记,这个春节,难度你没有发现特别适合猫在家听视频搞学习吗?而且我们还有一系列免费数据分析提供给 ...

  • 生信技能树精品文章合集-持续更新

    基因组系列 直播系列:我的基因组 解惑帖:我可能测了一个假的全基因组 一个标准的基因检测报告目录 数据分析 一篇文章学会ChIP-seq分析(上)         |       一篇文章学会ChIP ...

  • 我如何参与生信技能树论坛建设

    昨天推送的关于生信技能树论坛的公告大家反响很大: 我们的确有一个论坛,但并不希望随便一个阿猫阿狗都在上面发帖 我觉得吧,有些人还是太认真了,太玻璃心了.我们这个论坛所有帖子都是免费共享给所有人看的,只 ...

  • 谢谢你 生信技能树

    圣诞快乐 我怕三十晚上的祝福太多,你会看不到我的问候: 我怕初一的鞭炮太吵,你会听不到我的祝福: 我怕初二的菜肴太香,你会看不到我的短信: ...... 所以 ...... 现在给你写封信 生信技能树 ...

  • 我与生信技能树的故事

    jimmy 生信技能树联盟创始人 本文是<诚邀您加盟,生信技能树>发出后收集到的故事之一,如果你也有故事,不妨一起分享. 1.师兄和他的生信故事 2.墨如--我的生信故事 3.一只菜鸟生信 ...

  • 生信技能树公众号文章读后感

    jimmy 生信技能树联盟创始人 前段时间号召了一下大伙帮忙写我以前的公众号推文教程点评,以及我在B站的 57小时的全套生物信息学入门视频学习心得,欢迎大家继续提交读后感!!! <WGS.WES ...

  • 第一个生信技能树周边,生信 buff 加成神器来了

    生信技能树联盟成立至今,不仅为所有生信学习者带来了海量的学习资源,还陆续产生了很多象征着生信技能的标志.比如我们 logo 里生命力旺盛的那棵树,生信技能图谱,甚至还有一直陪在健明身边的那只羊. 我们 ...

  • 听说我们生信技能树论坛搜索功能失效?

    最近全国巡讲,相当于互联网地推的玩法让更多生物学界朋友了解我们生信技能树这个华语圈第一大社群,其中生信技能树论坛最受欢迎,不少朋友跃跃欲试想去搜索自己感兴趣的知识技能开始学起来,但是却很尴尬,出现了如 ...

  • 生信技能树投稿规范

    感谢大家对生信技能树平台的认可,选择在技能树发布自己精心准备的教程,和我一样为培养10万生信工程师而努力,但不少朋友的投稿格式过于随意,极大的增加了小编的任务量,特此公布投稿规范! 1.稿件格式 请使 ...