你们的相关性可能只是第三者插足

很多人挖掘公共数据库，比如TCGA等，会喜欢用到相关性分析，就是寻找那些表达量相关性比较高的， 然后就认为他们之间具有调控关系，可能是某些模块，但是我最近看的一篇文章，提到了这样的相关性其实是比较容易受其他因素影响，比如肿瘤纯度，如下图：

这里的肿瘤纯度，使用 a consensus measurement of purity estimations (CPE)指标，其实就是多种肿瘤纯度方法的整合。

可以看到，colony-stimulating factor 1 receptor (CSF1R) and Janus kinase 3 (JAK3) 两个基因的表达量在bladder癌症里面可以说是非常相关了，但其实是它们两个基因都受肿瘤纯度的影响。

参考文献：Systematic pan-cancer analysis of tumour purity